RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.48□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 PAX1P15863 534 aa9.48□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 LINC00158P58513 81 aa9.48□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa9.48□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 COQ2Q96H96 371 aa9.48□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 IZUMO1RA6ND01 250 aa9.47□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 C17orf100A8MU93 164 aa9.47□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 TIMM23O14925 209 aa9.47□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 HBDP02042 147 aa9.47□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 Q6ZRM9 215 aa9.47□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 TM4SF5O14894 197 aa9.47□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 CD164Q04900 197 aa9.47□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 EFNB3Q15768 340 aa9.47□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 ORMDL3Q8N138 153 aa9.47□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 AGMATQ9BSE5 352 aa9.47□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 LIME1Q9H400 295 aa9.47□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 SPRR3Q9UBC9 169 aa9.47□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 NDPQ00604 133 aa9.47□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 PINLYPA6NC86 204 aa9.47□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa9.47□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 NCR2O95944 276 aa9.46□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 ACYP1P07311 99 aa9.46□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 ELANEP08246 267 aa9.46□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 TREML4Q6UXN2 200 aa9.46□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 C8orf46Q8TAG6 207 aa9.46□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 THSD7BQ9C0I4 1608 aa9.46□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 APC2O95996 2303 aa9.46□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 IQCF6A8MYZ5 107 aa9.46□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 VWC2LB2RUY7 222 aa9.46□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 GGNQ86UU5 652 aa9.46□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 PRSS22Q9GZN4 317 aa9.46□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 SLC25A15Q9Y619 301 aa9.46□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 PFN2P35080 140 aa9.46□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 VMO1Q7Z5L0 202 aa9.46□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM105Q8N8V8 129 aa9.46□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 TIMM17AQ99595 171 aa9.46□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 GNB1LQ9BYB4 327 aa9.46□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 PAX9P55771 341 aa9.46□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 LINC01545Q5VT33 79 aa9.46□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 IGFL4Q6B9Z1 124 aa9.46□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 PSCAO43653 123 aa9.45□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 OTORQ9NRC9 128 aa9.45□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 MPV17L2Q567V2 206 aa9.45□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 LINC00312Q9Y6C7 94 aa9.45□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 FANCMQ8IYD8 2048 aa9.45□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 COL4A6Q14031 1691 aa9.45□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 NDUFA7O95182 113 aa9.45□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 BRD3OSQ6XYD6 125 aa9.45□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 C15orf61A6NNL5 157 aa9.45□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa9.45□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa9.44□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 Q6ZS49 121 aa9.44□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 MPLKIPQ8TAP9 179 aa9.44□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 SMIM26A0A096LP01 95 aa9.44□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 RNF182Q8N6D2 247 aa9.44□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 LINC00477Q96M19 166 aa9.44□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 LINC00694P0DN24 101 aa9.44□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 MORN2Q502X0 79 aa9.44□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 PLXNA2O75051 1894 aa9.44□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 PRSS29PA6NIE9 313 aa9.44□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 M0R2P5 195 aa9.44□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 PSPNO60542 156 aa9.44□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 FOXF2Q12947 444 aa9.44□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM30BQ3MIR4 351 aa9.44□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 Q6ZVH6 145 aa9.44□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 CDK2AP2O75956 126 aa9.44□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 C20orf204Q6ZNR8 217 aa9.44□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 TCF15Q12870 199 aa9.43□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 A0A1W2PPM0 123 aa9.43□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.43□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa9.43□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 RPRMLQ8N4K4 120 aa9.43□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.43□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa9.43□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM133Q9H2Q1 129 aa9.43□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.43□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa9.43□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 NCOR1O75376 2440 aa9.42□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 GNLYP22749 145 aa9.42□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 PAX8Q06710 450 aa9.42□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 RCHY1Q96PM5 261 aa9.42□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF138P52744 262 aa9.42□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.42□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 ROS1P08922 2347 aa9.42□□□□□ -0.9
CCBE1-202ENST00000439986 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms