RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439555.2

IRF1-204, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene IRF1, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-204ENST00000439555 OPCMLQ14982 345 aa8.1□□□□□ -1.11
IRF1-204ENST00000439555 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.1□□□□□ -1.11
IRF1-204ENST00000439555 C16orf74Q96GX8 76 aa8.1□□□□□ -1.11
IRF1-204ENST00000439555 ODF3Q96PU9 254 aa8.1□□□□□ -1.11
IRF1-204ENST00000439555 CBY3A6NI87 242 aa8.09□□□□□ -1.11
IRF1-204ENST00000439555 MPDU1O75352 247 aa8.09□□□□□ -1.11
IRF1-204ENST00000439555 CDK2AP2O75956 126 aa8.09□□□□□ -1.11
IRF1-204ENST00000439555 HTN3P15516 51 aa8.09□□□□□ -1.11
IRF1-204ENST00000439555 AZU1P20160 251 aa8.09□□□□□ -1.11
IRF1-204ENST00000439555 MORN5Q5VZ52 161 aa8.09□□□□□ -1.11
IRF1-204ENST00000439555 MIC13Q5XKP0 118 aa8.09□□□□□ -1.11
IRF1-204ENST00000439555 TMEM88Q6PEY1 159 aa8.09□□□□□ -1.11
IRF1-204ENST00000439555 STX12Q86Y82 276 aa8.09□□□□□ -1.11
IRF1-204ENST00000439555 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.09□□□□□ -1.11
IRF1-204ENST00000439555 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.09□□□□□ -1.11
IRF1-204ENST00000439555 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
IRF1-204ENST00000439555 H3BQ15 152 aa8.08□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 PRM2P04554 102 aa8.08□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 RAB32Q13637 225 aa8.08□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 Q6ZR54 194 aa8.08□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.08□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.08□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 HERC1Q15751 4861 aa8.08□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 IGSF23A1L1A6 192 aa8.07□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 SLC17A3O00476 420 aa8.07□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 ATP5G1P05496 136 aa8.07□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 DEFB130BP0DP73 79 aa8.07□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 DEFB130AP0DP74 79 aa8.07□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 ATP5G3P48201 142 aa8.07□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 S100A10P60903 97 aa8.07□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 PDE6HQ13956 83 aa8.07□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 PRELID1Q9Y255 219 aa8.07□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.06□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.06□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.06□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 PRAC2D3DTV9 90 aa8.06□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.06□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 RLN2P04090 185 aa8.06□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 CYCSP99999 105 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 BAXQ07812 192 aa8.06□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 SOHLH1Q5JUK2 328 aa8.06□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.06□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.06□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 SLC25A31Q9H0C2 315 aa8.06□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.06□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 F5H768 121 aa8.05□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 M0R2N4 97 aa8.05□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 PRAF2O60831 178 aa8.05□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 UPK1BO75841 260 aa8.05□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 CT45A10P0DMU9 189 aa8.05□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 HTN1P15515 57 aa8.05□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 FGF7P21781 194 aa8.05□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 LEPP41159 167 aa8.05□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 FCN2Q15485 313 aa8.05□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.05□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 ENKURQ8TC29 256 aa8.05□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 LINC00477Q96M19 166 aa8.05□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.05□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 NMES1Q9C002 83 aa8.05□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.04□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 E5RGE8 158 aa8.04□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 H3BTX0 84 aa8.04□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 NMBP08949 121 aa8.04□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 KIR3DS1Q14943 382 aa8.04□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 ZNF575Q86XF7 245 aa8.04□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 Q8N1X5 172 aa8.04□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.04□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 ZNF503Q96F45 646 aa8.04□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 ATG101Q9BSB4 218 aa8.04□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.04□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.03□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 NDUFB4O95168 129 aa8.03□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 CCL18P55774 89 aa8.03□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 NHLH2Q02577 135 aa8.03□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.03□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.03□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.03□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.03□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.03□□□□□ -1.12
IRF1-204ENST00000439555 A6NHS1 94 aa8.02□□□□□ -1.13
IRF1-204ENST00000439555 KLLNB2CW77 178 aa8.02□□□□□ -1.13
IRF1-204ENST00000439555 H3BNG1 76 aa8.02□□□□□ -1.13
IRF1-204ENST00000439555 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.02□□□□□ -1.13
IRF1-204ENST00000439555 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.02□□□□□ -1.13
IRF1-204ENST00000439555 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.02□□□□□ -1.13
IRF1-204ENST00000439555 C18orf15Q96N68 181 aa8.02□□□□□ -1.13
IRF1-204ENST00000439555 MARVELD1Q9BSK0 173 aa8.02□□□□□ -1.13
IRF1-204ENST00000439555 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.02□□□□□ -1.13
IRF1-204ENST00000439555 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.01□□□□□ -1.13
IRF1-204ENST00000439555 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.01□□□□□ -1.13
IRF1-204ENST00000439555 SNURFLB1AK76 121 aa8.01□□□□□ -1.13
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