RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 PFDN5Q99471 154 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-209ENST00000439106 NDUFAF3Q9BU61 184 aa9.83□□□□□ -0.84
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PRAME-209ENST00000439106 ZNF586Q9NXT0 402 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-209ENST00000439106 RNF24Q9Y225 148 aa9.83□□□□□ -0.84
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PRAME-209ENST00000439106 PRAF2O60831 178 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-209ENST00000439106 DAD1P61803 113 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-209ENST00000439106 LINC01587Q99440 93 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-209ENST00000439106 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa9.81□□□□□ -0.84
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PRAME-209ENST00000439106 P0DMU3 169 aa9.77□□□□□ -0.85
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PRAME-209ENST00000439106 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 C16orf74Q96GX8 76 aa9.77□□□□□ -0.85
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PRAME-209ENST00000439106 TMEM14CQ9P0S9 112 aa9.77□□□□□ -0.85
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PRAME-209ENST00000439106 MUC4Q99102 2169 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 ZNF253O75346 499 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 OR10J4P0C629 311 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
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PRAME-209ENST00000439106 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 HSPB11Q9Y547 144 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 KIAA1109Q2LD37 5005 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 H7BYZ3 331 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 ICAM4Q14773 271 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 FAM122CQ6P4D5 195 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 ALG5Q9Y673 324 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 F5H768 121 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 RPL12P30050 165 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 LEPP41159 167 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 FAM210BQ96KR6 192 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 OR51M1Q9H341 326 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 WFDC1Q9HC57 220 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 FUT9Q9Y231 359 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 C17orf112F2Z3M2 114 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 PET100P0DJ07 73 aa9.73□□□□□ -0.85
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PRAME-209ENST00000439106 PDE6HQ13956 83 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 FFAR4Q5NUL3 377 aa9.73□□□□□ -0.85
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PRAME-209ENST00000439106 ODF3Q96PU9 254 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-209ENST00000439106 VGLL1Q99990 258 aa9.73□□□□□ -0.85
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