RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 IFNA1P01562 189 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 PDE6HQ13956 83 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 NRN1Q9NPD7 142 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 MANBALQ9NQG1 85 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 GNG13Q9P2W3 67 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.22□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 ZNF253O75346 499 aa9.22□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 UBE2G2P60604 165 aa9.22□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 C17orf77Q96MU5 243 aa9.22□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 MS4A6AQ9H2W1 248 aa9.22□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa9.22□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
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PRAME-208ENST00000438888 CXorf65A6NEN9 183 aa9.21□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 SLC17A3O00476 420 aa9.21□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 TSPAN4O14817 238 aa9.21□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 PAGE4O60829 102 aa9.21□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 NDUFB4O95168 129 aa9.21□□□□□ -0.94
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PRAME-208ENST00000438888 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.21□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 GBGT1Q8N5D6 347 aa9.21□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.21□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 TRAV2A0A0B4J234 112 aa9.2□□□□□ -0.94
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PRAME-208ENST00000438888 CST9LP1Q5W188 147 aa9.2□□□□□ -0.94
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PRAME-208ENST00000438888 LYPD1Q8N2G4 141 aa9.2□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 DCANP1Q8TF63 244 aa9.2□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 LINC00476Q8WZB0 136 aa9.2□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 C16orf92Q96LL3 132 aa9.2□□□□□ -0.94
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PRAME-208ENST00000438888 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
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PRAME-208ENST00000438888 Q9H3A6 140 aa9.2□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 AAMDCQ9H7C9 122 aa9.2□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 OTORQ9NRC9 128 aa9.2□□□□□ -0.94
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PRAME-208ENST00000438888 RBFOX3A6NFN3 312 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 GGTLC3B5MD39 225 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 K7EQG2 157 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 ISLRO14498 428 aa9.19□□□□□ -0.94
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PRAME-208ENST00000438888 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.19□□□□□ -0.94
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PRAME-208ENST00000438888 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 A0A0J9YWU9 116 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 LINC00862A6NCI5 91 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 PGPA6NDG6 321 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 OR4C46A6NHA9 309 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 C11orf94C9JXX5 98 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 ID1P41134 155 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 ATP5G3P48201 142 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 ICAM4Q14773 271 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 ZNF506Q5JVG8 444 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 RARRES2Q99969 163 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 TXNDC17Q9BRA2 123 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 RAB19A4D1S5 217 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 HLA-DMBP28068 263 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 DEFB135Q30KP9 77 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 IGFL4Q6B9Z1 124 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 COMMD7Q86VX2 200 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 RNF182Q8N6D2 247 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 C5orf17Q8NAS9 161 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 CMTM2Q8TAZ6 248 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 PRELID1Q9Y255 219 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 ZNF688P0C7X2 276 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 CSN1S1P47710 185 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 PEA15Q15121 130 aa9.16□□□□□ -0.94
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PRAME-208ENST00000438888 CCDC28AQ8IWP9 274 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 FAM24BQ8N5W8 94 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 ZNF738Q8NE65 137 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 C20orf173Q96LM9 149 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 LINC00052Q96N35 136 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 TCEAL7Q9BRU2 100 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 NUPR2A6NF83 97 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-208ENST00000438888 F6UZH7 168 aa9.15□□□□□ -0.94
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