RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431803.2

CDC42-IT1-201, CDC42 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42-IT1, Length 692 nt, Biotype sense intronic.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-IT1-201ENST00000431803 AGPAT2O15120 278 aa6.6□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DEFB130BP0DP73 79 aa6.6□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DEFB130AP0DP74 79 aa6.6□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IL7P13232 177 aa6.6□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CDKN1BP46527 198 aa6.6□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RHOBP62745 196 aa6.6□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.6□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LCN15Q6UWW0 184 aa6.6□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.6□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C16orf74Q96GX8 76 aa6.6□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MGST2Q99735 147 aa6.6□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.6□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CBY3A6NI87 242 aa6.59□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CENPXA8MT69 81 aa6.59□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GOSR2O14653 212 aa6.59□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ATP5G1P05496 136 aa6.59□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGLC2P0DOY2 106 aa6.59□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ATP5G3P48201 142 aa6.59□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FCN2Q15485 313 aa6.59□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.59□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.59□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MORN5Q5VZ52 161 aa6.59□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.59□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.59□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LINC01587Q99440 93 aa6.59□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.59□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.59□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 F5H768 121 aa6.58□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 H7BYZ3 331 aa6.58□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC17A3O00476 420 aa6.58□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PLA2G10O15496 165 aa6.58□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 COX7A2P2O60397 106 aa6.58□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OPCMLQ14982 345 aa6.58□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.58□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.58□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.58□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.58□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.58□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ATG101Q9BSB4 218 aa6.58□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.58□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.58□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MUC4Q99102 2169 aa6.57□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.57□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRAC2D3DTV9 90 aa6.57□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 H3BQ15 152 aa6.57□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CCSO14618 274 aa6.57□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HTN1P15515 57 aa6.57□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CAMLGP49069 296 aa6.57□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 VWC2Q2TAL6 325 aa6.57□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.57□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.57□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF575Q86XF7 245 aa6.57□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.57□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 H3BTX0 84 aa6.56□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LYRM1O43325 122 aa6.56□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NUDT3O95989 172 aa6.56□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CAV2P51636 162 aa6.56□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF846Q147U1 533 aa6.56□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GUK1Q16774 197 aa6.56□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.56□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.56□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ODF3Q96PU9 254 aa6.56□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.56□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NUDT15Q9NV35 164 aa6.56□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.56□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.56□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.55□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM25EA8MYX2 175 aa6.55□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 L7N2F9 121 aa6.55□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF253O75346 499 aa6.55□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CST7O76096 145 aa6.55□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TCRBP04435 133 aa6.55□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CT45A10P0DMU9 189 aa6.55□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CCL18P55774 89 aa6.55□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 VAMP2P63027 116 aa6.55□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RAB31Q13636 194 aa6.55□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MIC13Q5XKP0 118 aa6.55□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 Q6ZRG5 221 aa6.55□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C6orf223Q8N319 242 aa6.55□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF503Q96F45 646 aa6.55□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.55□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.54□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.54□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.54□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 M6PRP20645 277 aa6.54□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SULT1A1P50225 295 aa6.54□□□□□ -1.36
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