RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FXYD5Q96DB9 178 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF503Q96F45 646 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR51M1Q9H341 326 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CELA1Q9UNI1 258 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNF222A6NCQ9 220 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMIM9A6NGZ8 99 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 M0R3E3 92 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AMBPP02760 352 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TIMM9Q9Y5J7 89 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP17.94■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR10J4P0C629 311 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PAXXQ9BUH6 204 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TNFSF18Q9UNG2 199 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 INSP01308 110 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NBEAP1P0C6P0 100 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRM2P04554 102 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR10J6PQ8NGY7 276 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNF141Q8WVD5 230 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CT45A10P0DMU9 189 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RAB2AP61019 212 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF266Q14584 549 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIR3DS1Q14943 382 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NPIPB6E9PJ23 425 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR7C2O60412 319 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HBE1P02100 147 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDKN1BP46527 198 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EMP1P54849 157 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C12orf74Q32Q52 190 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 Q6ZTC4 211 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF767PQ75MW2 155 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PHYHIPLQ96FC7 376 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM208Q9BTX3 173 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRELID1Q9Y255 219 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 M6PRP20645 277 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ICAM4Q14773 271 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM189A5PLL7 270 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMLR1H3BR10 107 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATP6V0CP27449 155 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ERCC8Q13216 396 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RRN3P1Q2M238 152 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR2G3Q8NGZ4 309 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KHDC3LQ587J8 217 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SH3BGRL3Q9H299 93 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AAMDCQ9H7C9 122 aa17.87■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 JTBO76095 146 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TAS2R45P59539 299 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM122CQ6P4D5 195 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR10G4Q8NGN3 311 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR10G9Q8NGN4 311 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR10G7Q8NGN6 311 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ODF3Q96PU9 254 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DKK2Q9UBU2 259 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPART-AS1P0CW21 52 aa17.85■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AZU1P20160 251 aa17.85■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GFI1BQ5VTD9 330 aa17.85■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa17.85■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C11orf94C9JXX5 98 aa17.84■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TSPOP30536 169 aa17.84■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RANP62826 216 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM222AQ5U5X8 452 aa17.84■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM19A4Q96LR4 140 aa17.84■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LINC01587Q99440 93 aa17.84■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa17.84■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VPS13DQ5THJ4 4388 aa17.84■□□□□ 0.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A1W2PPV4 95 aa17.83■□□□□ 0.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARPC5O15511 151 aa17.83■□□□□ 0.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM256Q8N2U0 113 aa17.83■□□□□ 0.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C2CD4CQ8TF44 421 aa17.83■□□□□ 0.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 Q9H3A6 140 aa17.83■□□□□ 0.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLAC8L1A1L4L8 177 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 J3KRW8 73 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LYPD1Q8N2G4 141 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LINC00476Q8WZB0 136 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LINC00477Q96M19 166 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VGLL1Q99990 258 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRAV10A0A0B4J240 114 aa17.81■□□□□ 0.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LEPP41159 167 aa17.81■□□□□ 0.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TAS2R60P59551 318 aa17.81■□□□□ 0.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SERF2P84101 59 aa17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 130 ms