RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423693.5

HDLBP-210, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-210ENST00000423693 HLA-DMBP28068 263 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 CNN1P51911 297 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 DEFB1P60022 68 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 BAP18Q8IXM2 172 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 OR10J6PQ8NGY7 276 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 STOML3Q8TAV4 291 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 RETNQ9HD89 108 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 AGRNO00468 2067 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 A0A1B0GVG6 124 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 UMAD1C9J7I0 102 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 CXorf1O96002 111 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 TPT1P13693 172 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 AMTNQ6UX39 209 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 SUN5Q8TC36 379 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 RARRES2Q99969 163 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 IGKV3-20P01619 116 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 RANP62826 216 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 ZFP69Q49AA0 526 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 OTORQ9NRC9 128 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 TMEM167BQ9NRX6 74 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 XCL2Q9UBD3 114 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 PRAC2D3DTV9 90 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 GCHFRP30047 84 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 CSN1S1P47710 185 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 ICAM4Q14773 271 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 FAM74A1Q5RGS3 127 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 OR11H2Q8NH07 326 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 LINC00477Q96M19 166 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 ODF3Q96PU9 254 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 SLC35B3Q9H1N7 401 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 Q9H3A6 140 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 EDA2RQ9HAV5 297 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 NPIPB6E9PJ23 425 aa9.42□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa9.42□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 M0R3E3 92 aa9.42□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 TSPOP30536 169 aa9.42□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 SLC51BQ86UW2 128 aa9.42□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 RBAKDNA6NC62 111 aa9.41□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.41□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 MIFP14174 115 aa9.41□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 CDKN1BP46527 198 aa9.41□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 RAB5CP51148 216 aa9.41□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 CD300CQ08708 224 aa9.41□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF726P1Q15940 193 aa9.41□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.41□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 C9orf62Q8N4C0 152 aa9.41□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 IL17DQ8TAD2 202 aa9.41□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa9.41□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 NEU1Q99519 415 aa9.41□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa9.41□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 COL7A1Q02388 2944 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 A0A1W2PRE2 83 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 PGPA6NDG6 321 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 INSP01308 110 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 LEPP41159 167 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 FXYD7P58549 80 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 SSX7Q7RTT5 188 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 CMTM2Q8TAZ6 248 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
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HDLBP-210ENST00000423693 DIRC3C9JPN6 131 aa9.39□□□□□ -0.91
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HDLBP-210ENST00000423693 CT45A10P0DMU9 189 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-210ENST00000423693 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-210ENST00000423693 TMEM78Q5T7P6 136 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-210ENST00000423693 TMEM256Q8N2U0 113 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-210ENST00000423693 TMED6Q8WW62 240 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-210ENST00000423693 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-210ENST00000423693 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-210ENST00000423693 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-210ENST00000423693 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-210ENST00000423693 X6R8D5 127 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-210ENST00000423693 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-210ENST00000423693 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa9.38□□□□□ -0.91
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