RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.69□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 TET1Q8NFU7 2136 aa5.69□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.68□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 APOC4P55056 127 aa5.68□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.68□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 H0YGX0 51 aa5.68□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 H3BUT2 72 aa5.68□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 GAGE2BQ13066 116 aa5.68□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF726P1Q15940 193 aa5.68□□□□□ -1.5
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ALMS1-201ENST00000423048 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.68□□□□□ -1.5
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ALMS1-201ENST00000423048 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
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ALMS1-201ENST00000423048 GATD1Q8NB37 220 aa5.67□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa5.67□□□□□ -1.5
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ALMS1-201ENST00000423048 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa5.67□□□□□ -1.5
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ALMS1-201ENST00000423048 MDKP21741 143 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
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ALMS1-201ENST00000423048 CARD19Q96LW7 228 aa5.67□□□□□ -1.5
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ALMS1-201ENST00000423048 TRGV2A0A075B6R0 118 aa5.66□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa5.66□□□□□ -1.5
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ALMS1-201ENST00000423048 MALP21145 153 aa5.66□□□□□ -1.5
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ALMS1-201ENST00000423048 ZNF491Q8N8L2 437 aa5.66□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 CSTL1Q9H114 145 aa5.66□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 KIF26BQ2KJY2 2108 aa5.66□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.66□□□□□ -1.5
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ALMS1-201ENST00000423048 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.66□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 DEFB125Q8N687 156 aa5.66□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 TMEM131Q92545 1883 aa5.66□□□□□ -1.5
ALMS1-201ENST00000423048 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa5.65□□□□□ -1.5
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ALMS1-201ENST00000423048 CGB7P0DN87 165 aa5.65□□□□□ -1.5
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ALMS1-201ENST00000423048 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.65□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa5.65□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 LGALS9O00182 355 aa5.65□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.65□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 CEND1Q8N111 149 aa5.65□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF747Q9BV97 191 aa5.65□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 MYOFQ9NZM1 2061 aa5.65□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 TGFAP01135 160 aa5.64□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.64□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 C8orf86Q6ZUL3 223 aa5.64□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 FAM19A2Q8N3H0 131 aa5.64□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5.64□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 H3BT86 120 aa5.64□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.64□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 FAM215AQ9Y5M1 114 aa5.64□□□□□ -1.51
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ALMS1-201ENST00000423048 TRAV3A0A0B4J244 114 aa5.64□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 SAA4P35542 130 aa5.64□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 PIP4P2Q8N4L2 257 aa5.64□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.64□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 C9JQL5 133 aa5.64□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 ARMS2P0C7Q2 107 aa5.64□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 EMP1P54849 157 aa5.64□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa5.64□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 TMEM243Q9BU79 118 aa5.64□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 TRAV5A0A0B4J249 113 aa5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 H3BMG7 143 aa5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 CKS1BP61024 79 aa5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 WT1-ASQ06250 92 aa5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 GCSAMLQ5JQS6 135 aa5.63□□□□□ -1.51
ALMS1-201ENST00000423048 PRSS57Q6UWY2 283 aa5.63□□□□□ -1.51
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