RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 B4DSR2 109 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 CD59P13987 128 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 Q6ZS49 121 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 CYYR1Q96J86 154 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 SPRR3Q9UBC9 169 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 AMN1Q8IY45 258 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 Q8TAT8 98 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 C15orf32Q32M92 178 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 DENND4CQ5VZ89 1909 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 SRRM5B3KS81 715 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 MLNRO43193 412 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 RPL15P61313 204 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 MMP23AO75900 390 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 SPINK8P0C7L1 97 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 LIME1Q9H400 295 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 NPC2P61916 151 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 FAM223BA6NKX1 122 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 PAX9P55771 341 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM158Q8WZ71 300 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 M0R1W7 72 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF726P1Q15940 193 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 CD177Q8N6Q3 437 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 CSTL1Q9H114 145 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.2□□□□□ -1.26
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PTPRM-202ENST00000400053 Q6P435 159 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 DEFB121Q5J5C9 76 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 IGLL1P15814 213 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM258P61165 79 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 ETDBQ3ZM63 59 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF114Q8NC26 417 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 PCNX2A6NKB5 2137 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 FNDC10F2Z333 226 aa7.2□□□□□ -1.26
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PTPRM-202ENST00000400053 C9JAW5 83 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRM-202ENST00000400053 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM141Q96I45 108 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRM-202ENST00000400053 C5orf64Q2M2E5 130 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRM-202ENST00000400053 SH2D1AO60880 128 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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PTPRM-202ENST00000400053 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.18□□□□□ -1.26
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PTPRM-202ENST00000400053 PROK2Q9HC23 129 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 U3KQA8 63 aa7.18□□□□□ -1.26
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PTPRM-202ENST00000400053 K7EP13 123 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPRM-202ENST00000400053 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM213A2RRL7 107 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 IGHG3P01860 377 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 GATA3P23771 443 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRM-202ENST00000400053 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.17□□□□□ -1.26
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