RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379918.8

CAGE1-203, Transcript of cancer antigen 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAGE1, Length 2,877 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAGE1-203	ENST00000379918	GAGE1	Q13065	139 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	USP24	Q9UPU5	2620 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	CBY3	A6NI87	242 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	LINC01548	A6NM66	108 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	VSTM5	A8MXK1	200 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	PSG3	Q16557	428 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	RNF182	Q8N6D2	247 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	RNF24	Q9Y225	148 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	PRAC2	D3DTV9	90 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	SPRY2	O43597	315 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	ERCC8	Q13216	396 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	COX11	Q9Y6N1	276 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	C20orf202	A1L168	122 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	SH2D1A	O60880	128 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	IGHG4	P01861	327 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	LIPF	P07098	398 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	CT83	Q5H943	113 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF575	Q86XF7	245 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	DPM3	Q9P2X0	92 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	CREBBP	Q92793	2442 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	UQCRFS1	P47985	274 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	ECSCR	Q19T08	205 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	TNFRSF14	Q92956	283 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	C18orf15	Q96N68	181 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	SORL1	Q92673	2214 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918		G3V318	75 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	EVI2A	P22794	236 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	GPR183	P32249	361 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF747	Q9BV97	191 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	TAX1BP3	O14907	124 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	NPY	P01303	97 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	CTSG	P08311	255 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	OR5AL1	P0C617	328 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	TMEM11	P17152	192 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	DEFB1	P60022	68 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	VAMP3	Q15836	100 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	TM4SF20	Q53R12	229 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	ARPC1A	Q92747	370 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	SMIM12	Q96EX1	92 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	TMEM189	A5PLL7	270 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918		K7EMI3	77 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918		K7ENP7	123 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	CACNG7	P62955	275 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	RHOG	P84095	191 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	FA2H	Q7L5A8	372 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF738	Q8NE65	137 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	RAX	Q9Y2V3	346 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918		J3KRW8	73 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918		K7EP13	123 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	CT45A10	P0DMU9	189 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	RIG	Q13278	110 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	UBE2V1	Q13404	147 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CAGE1-203	ENST00000379918	TWIST1	Q15672	202 aa		5.47	□□□□□ -1.53

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