RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369592.1

SMNDC1-201, Transcript of survival motor neuron domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene SMNDC1, Length 1,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMNDC1-201ENST00000369592 INSP01308 110 aa14.65□□□□□ -0.06
SMNDC1-201ENST00000369592 HBE1P02100 147 aa14.65□□□□□ -0.06
SMNDC1-201ENST00000369592 SPART-AS1P0CW21 52 aa14.65□□□□□ -0.06
SMNDC1-201ENST00000369592 RPL12P30050 165 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SMNDC1-201ENST00000369592 ZNF767PQ75MW2 155 aa14.65□□□□□ -0.06
SMNDC1-201ENST00000369592 DNAH6Q9C0G6 4158 aa14.65□□□□□ -0.06
SMNDC1-201ENST00000369592 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa14.64□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 PDE6HQ13956 83 aa14.64□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 RRN3P1Q2M238 152 aa14.64□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 WFDC1Q9HC57 220 aa14.64□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa14.63□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 PLAC8L1A1L4L8 177 aa14.63□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 PRM2P04554 102 aa14.63□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 PYYP10082 97 aa14.63□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 TSPOP30536 169 aa14.63□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 OXA1LQ15070 435 aa14.63□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 FAM222AQ5U5X8 452 aa14.63□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.63□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.63□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 IGLL5B9A064 214 aa14.62□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 NPIPB6E9PJ23 425 aa14.62□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 RHOBP62745 196 aa14.62□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 FCN2Q15485 313 aa14.62□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 ODF3Q96PU9 254 aa14.62□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa14.61□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa14.61□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 CDKN1BP46527 198 aa14.61□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 EMP1P54849 157 aa14.61□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 KIR3DS1Q14943 382 aa14.61□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 TMEM256Q8N2U0 113 aa14.61□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa14.6□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 M0R3E3 92 aa14.6□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 CT45A10P0DMU9 189 aa14.6□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 AZU1P20160 251 aa14.6□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 OR10J6PQ8NGY7 276 aa14.6□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 FXYD5Q96DB9 178 aa14.6□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 ZNF503Q96F45 646 aa14.6□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa14.6□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 FUT9Q9Y231 359 aa14.6□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 C17orf112F2Z3M2 114 aa14.59□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 FAM19A4Q96LR4 140 aa14.59□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 C20orf144Q9BQM9 153 aa14.59□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa14.59□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 TMEM208Q9BTX3 173 aa14.59□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 SMIM3Q9BZL3 60 aa14.59□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 PRELID1Q9Y255 219 aa14.59□□□□□ -0.07
SMNDC1-201ENST00000369592 TAS2R60P59551 318 aa14.58□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 MED28Q9H204 178 aa14.58□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 OR51M1Q9H341 326 aa14.58□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 NBEAP1P0C6P0 100 aa14.57□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 Q5BKY6 102 aa14.57□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.57□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa14.57□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa14.57□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 DNAH10Q8IVF4 4471 aa14.56□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 IFNA5P01569 189 aa14.56□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 FFAR4Q5NUL3 377 aa14.56□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 BLNKQ8WV28 456 aa14.56□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 AQP10Q96PS8 301 aa14.56□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 LINC01587Q99440 93 aa14.56□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 PAXXQ9BUH6 204 aa14.56□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 TIMM9Q9Y5J7 89 aa14.56□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 LYRM9A8MSI8 78 aa14.55□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 H7BYZ3 331 aa14.55□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 GIPP09681 153 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa14.55□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 SCGB1C1Q8TD33 95 aa14.55□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 RNF141Q8WVD5 230 aa14.55□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 ASB13Q8WXK3 278 aa14.55□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 FAM210BQ96KR6 192 aa14.55□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa14.55□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 FRAS1Q86XX4 4008 aa14.54□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 ICAM4Q14773 271 aa14.54□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 PHYHIPLQ96FC7 376 aa14.54□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 LINC00477Q96M19 166 aa14.54□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa14.54□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa14.54□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 KLLNB2CW77 178 aa14.53□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 OR10J4P0C629 311 aa14.53□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 LEPP41159 167 aa14.53□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 ERCC8Q13216 396 aa14.53□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 ZNF493Q6ZR52 646 aa14.53□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 RYR1P21817 5038 aa14.52□□□□□ -0.08
SMNDC1-201ENST00000369592 CRISP2P16562 243 aa14.52□□□□□ -0.09
SMNDC1-201ENST00000369592 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SMNDC1-201ENST00000369592 C16orf74Q96GX8 76 aa14.52□□□□□ -0.09
SMNDC1-201ENST00000369592 AAMDCQ9H7C9 122 aa14.52□□□□□ -0.09
SMNDC1-201ENST00000369592 G3V3Q6 166 aa14.51□□□□□ -0.09
SMNDC1-201ENST00000369592 M6PRP20645 277 aa14.51□□□□□ -0.09
SMNDC1-201ENST00000369592 DAD1P61803 113 aa14.51□□□□□ -0.09
SMNDC1-201ENST00000369592 RGS21Q2M5E4 152 aa14.51□□□□□ -0.09
SMNDC1-201ENST00000369592 LYPD1Q8N2G4 141 aa14.51□□□□□ -0.09
SMNDC1-201ENST00000369592 LINC00612Q8N6U2 182 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms