RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 WT1P19544 449 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 FOXI2Q6ZQN5 318 aa14.89□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 ZZEF1O43149 2961 aa14.88□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 E9PLD3 99 aa14.88□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 EVI2AP22794 236 aa14.88□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 GLRXP35754 106 aa14.88□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 TMEM164Q5U3C3 297 aa14.88□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 FOXC2Q99958 501 aa14.88□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 RASL11BQ9BPW5 248 aa14.88□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 SPATA25Q9BR10 227 aa14.88□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 HIGD1BQ9P298 99 aa14.88□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 DKK4Q9UBT3 224 aa14.88□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 F8W1H4 67 aa14.88□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 FCER1GP30273 86 aa14.88□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 GATA4P43694 442 aa14.88□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa14.88□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 LCNL1Q6ZST4 164 aa14.88□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa14.88□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 MSRB1Q9NZV6 116 aa14.88□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 PPIFP30405 207 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 TMEM30BQ3MIR4 351 aa14.87□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa14.87□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 SCGB2A2Q13296 93 aa14.87□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 IGKCP01834 107 aa14.87□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.87□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa14.86□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 TMEM160Q9NX00 188 aa14.86□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 S4R3C0 116 aa14.86□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 PKDREJQ9NTG1 2253 aa14.86□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 PRRG2O14669 202 aa14.85□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa14.85□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 NPIPB5A8MRT5 1133 aa14.85□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 IGKV1-17P01599 117 aa14.85□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 TM2D2Q9BX73 214 aa14.85□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 TPRP12270 2363 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 TMEM8BA6NDV4 472 aa14.84□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 CRYBA4P53673 196 aa14.84□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 C20orf78Q9BR46 151 aa14.84□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 DMXL1Q9Y485 3027 aa14.84□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa14.84□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 IGHG3P01860 377 aa14.84□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 C12orf74Q32Q52 190 aa14.84□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 GAGE13Q4V321 117 aa14.84□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 Q8TAT8 98 aa14.84□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 MAP1LC3AQ9H492 121 aa14.84□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa14.83□□□□□ -0.03
PRPF39-201ENST00000355765 TRAV40A0A0B4J280 105 aa14.83□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 CD59P13987 128 aa14.83□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 ZMAT4Q9H898 229 aa14.83□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 CSMD1Q96PZ7 3565 aa14.83□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 PVRIGQ6DKI7 326 aa14.83□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 CCL11P51671 97 aa14.82□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 PLA2G2CQ5R387 149 aa14.82□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 LYPD2Q6UXB3 125 aa14.82□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 TMEM158Q8WZ71 300 aa14.82□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa14.82□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 A0A1B0GWB2 263 aa14.82□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 IL4P05112 153 aa14.82□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 FAM169BQ8N8A8 192 aa14.82□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 TACC2O95359 2948 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 TEX22C9J3V5 150 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 H3BRN7 92 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 DPM2O94777 84 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF883P0CG24 379 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 TEX36Q5VZQ5 186 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 C22orf34Q6ZV56 151 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 PIFOQ8TCI5 191 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 HIST1H4GQ99525 98 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 FBXL15Q9H469 300 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 SIGLEC9Q9Y336 463 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 I3L2K1 104 aa14.8□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 IGFL4Q6B9Z1 124 aa14.8□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 RNF185Q96GF1 192 aa14.8□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa14.8□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 MC5RP33032 325 aa14.8□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 PRO0461Q9UI25 63 aa14.8□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa14.8□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 CEP250Q9BV73 2442 aa14.8□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 TNFRSF6BO95407 300 aa14.79□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 SEM1Q6ZVN7 128 aa14.79□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 MRAP2Q96G30 205 aa14.79□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 AAMDCQ9H7C9 122 aa14.79□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 K7EM74 188 aa14.78□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa14.78□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 SFTA2Q6UW10 78 aa14.78□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF491Q8N8L2 437 aa14.78□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 RNF125Q96EQ8 232 aa14.78□□□□□ -0.04
PRPF39-201ENST00000355765 APOMO95445 188 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms