RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323829.9

SH3TC2-201, Transcript of SH3 domain and tetratricopeptide repeats 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SH3TC2, Length 7,324 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC2-201ENST00000323829 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 SRXN1Q9BYN0 137 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 COL4A5P29400 1685 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 Q6ZT83 130 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 COX7B2Q8TF08 81 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 MYLKQ15746 1914 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 E9PLN8 166 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 PPBPP02775 128 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 ZNF319Q9P2F9 582 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 H3BUX3 64 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 IGHV3-30P01768 117 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 IGHV3-33P01772 117 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 CARD19Q96LW7 228 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 FAM27BQ5VT28 67 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 AMBPP02760 352 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 TIMP3P35625 211 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 NREPQ16612 68 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 GFI1Q99684 422 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 X6R8D5 127 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 SH2D1AO60880 128 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 STPG4Q8N801 248 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 LIME1Q9H400 295 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 A0A096LNI7 61 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 TM4SF5O14894 197 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 F8W735 103 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 CD55P08174 381 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 DOCK3Q8IZD9 2030 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 IL18BPO95998 194 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 OR9G9P0C7N8 305 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 A0A1B0GW64 132 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 NCR3O14931 201 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 CXCL1P09341 107 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 SIPA1L1O43166 1804 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 PSMB8P28062 276 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 LYPD6Q86Y78 171 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 ZNF138P52744 262 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 LCTP09848 1927 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 HEATR5AQ86XA9 2040 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 IL17RELQ6ZVW7 336 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 CTHRC1Q96CG8 243 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 RNF138Q8WVD3 245 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 RFNGQ9Y644 331 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 AKAP6Q13023 2319 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 MYO7BQ6PIF6 2116 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 ABCA4P78363 2273 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 RFPL3SP0C7P2 107 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 HLA-DRB4P13762 266 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 AMN1Q8IY45 258 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 SMPXQ9UHP9 88 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 A0A0G2JMZ2 1700 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 LRRC37A2A6NM11 1700 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 LRRC37AA6NMS7 1700 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 WDR81Q562E7 1941 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 IGHV2-5P01817 119 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 DYSFO75923 2080 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 C4orf51C9J302 202 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 OSTCQ9NRP0 149 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa7.21□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.21□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.21□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 Q96M66 194 aa7.21□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 RNF223E7ERA6 249 aa7.21□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 H3BMG7 143 aa7.21□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 C9orf106Q8NAJ2 232 aa7.21□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 CADP27708 2225 aa7.21□□□□□ -1.25
SH3TC2-201ENST00000323829 PATJQ8NI35 1801 aa7.21□□□□□ -1.26
SH3TC2-201ENST00000323829 MED12Q93074 2177 aa7.21□□□□□ -1.26
SH3TC2-201ENST00000323829 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.21□□□□□ -1.26
SH3TC2-201ENST00000323829 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.21□□□□□ -1.26
SH3TC2-201ENST00000323829 M0R1W7 72 aa7.21□□□□□ -1.26
SH3TC2-201ENST00000323829 TMEM30BQ3MIR4 351 aa7.21□□□□□ -1.26
SH3TC2-201ENST00000323829 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.2□□□□□ -1.26
SH3TC2-201ENST00000323829 IGHV1-8P0DP01 117 aa7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms