RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 ACANP16112 2415 aa7.74□□□□□ -1.17
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RABGGTB-201ENST00000319942 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-201ENST00000319942 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-201ENST00000319942 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.74□□□□□ -1.17
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RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP10-2P60368 255 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-201ENST00000319942 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-201ENST00000319942 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-201ENST00000319942 SMR3AQ99954 134 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFP30Q9Y2G7 519 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-201ENST00000319942 PDZD2O15018 2839 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-201ENST00000319942 VPS13CQ709C8 3753 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-201ENST00000319942 DIRC3C9JPN6 131 aa7.73□□□□□ -1.17
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RABGGTB-201ENST00000319942 ELOBQ15370 118 aa7.73□□□□□ -1.17
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RABGGTB-201ENST00000319942 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-201ENST00000319942 C16orf95Q9H693 158 aa7.73□□□□□ -1.17
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RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-201ENST00000319942 OSTCQ9NRP0 149 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-201ENST00000319942 SMPXQ9UHP9 88 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-201ENST00000319942 K7EN84 100 aa7.72□□□□□ -1.17
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RABGGTB-201ENST00000319942 LTAP01374 205 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLV2-8P01709 118 aa7.72□□□□□ -1.17
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RABGGTB-201ENST00000319942 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
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RABGGTB-201ENST00000319942 FOXL1Q12952 345 aa7.72□□□□□ -1.17
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RABGGTB-201ENST00000319942 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-201ENST00000319942 LCN12Q6JVE5 192 aa7.72□□□□□ -1.17
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RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM210BQ96KR6 192 aa7.71□□□□□ -1.18
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RABGGTB-201ENST00000319942 LINC01619G3V211 115 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-201ENST00000319942 M0QZ24 198 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-201ENST00000319942 M0R3E3 92 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-201ENST00000319942 CHEK1O14757 476 aa7.7□□□□□ -1.18
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RABGGTB-201ENST00000319942 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
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RABGGTB-201ENST00000319942 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.7□□□□□ -1.18
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RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.69□□□□□ -1.18
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RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFA7O95182 113 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLV2-11P01706 119 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-201ENST00000319942 ID1P41134 155 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-201ENST00000319942 SYNJ2BPP57105 145 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB5BP61020 215 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-201ENST00000319942 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-201ENST00000319942 OR1N2Q8NGR9 330 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-201ENST00000319942 NUDT11Q96G61 164 aa7.69□□□□□ -1.18
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