RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317945.6

CCDC34-201, Transcript of coiled-coil domain containing 34, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC34, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34-201ENST00000317945 OR9G4Q8NGQ1 327 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC34-201ENST00000317945 ASCL2Q99929 193 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC34-201ENST00000317945 BOD1L2Q8IYS8 172 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC34-201ENST00000317945 TIMD4Q96H15 378 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC34-201ENST00000317945 HILPDAQ9Y5L2 63 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC34-201ENST00000317945 PPBPP02775 128 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC34-201ENST00000317945 IGLC6P0CF74 106 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC34-201ENST00000317945 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CCDC34-201ENST00000317945 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC34-201ENST00000317945 OR8A1Q8NGG7 326 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC34-201ENST00000317945 LINC01546A6NGU7 62 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC34-201ENST00000317945 FAM106CPP0CH98 169 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC34-201ENST00000317945 FAM106AQ4KMX7 169 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC34-201ENST00000317945 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC34-201ENST00000317945 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC34-201ENST00000317945 CNFNQ9BYD5 112 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC34-201ENST00000317945 RABAC1Q9UI14 185 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC34-201ENST00000317945 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC34-201ENST00000317945 CBY3A6NI87 242 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC34-201ENST00000317945 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CCDC34-201ENST00000317945 EBI3Q14213 229 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC34-201ENST00000317945 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 CKS2P33552 79 aa14.71□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 HES1Q14469 280 aa14.71□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 LINC01559Q495D7 138 aa14.71□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 PIP4P2Q8N4L2 257 aa14.71□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 Q8N6K4 173 aa14.71□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 PIFOQ8TCI5 191 aa14.71□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 IFI27L1Q96BM0 104 aa14.71□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 ZFHX4Q86UP3 3567 aa14.71□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 A6NDN8 102 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 RAB9AP51151 201 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 ANKRD39Q53RE8 183 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 LINC01560Q8TB33 94 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 C7orf71A4D174 169 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 H3BRM9 83 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 OR4X2Q8NGF9 303 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 CST9LQ9H4G1 147 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 HSD52Q0P140 79 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 TWIST1Q15672 202 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 MINOS1Q5TGZ0 78 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 CACNG7P62955 275 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 S4R3C0 116 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 ZGRF1Q86YA3 2104 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 CTSGP08311 255 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 KLK9Q2XQG4 91 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 KLK9Q9UKQ9 250 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 A1L4Q6 167 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 FABP5P3A8MUU1 101 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 NPYP01303 97 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 MAP1LC3AQ9H492 121 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 NCOR2Q9Y618 2525 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 RBAKDNA6NC62 111 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 NDPQ00604 133 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 OCIAD2Q56VL3 154 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 LAMA5O15230 3695 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 NDUFS7O75251 213 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 IGHG4P01861 327 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 KLRD1Q13241 179 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 C9orf118A6NHY6 69 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 ERASQ7Z444 233 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 VGLL1Q99990 258 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 VMO1Q7Z5L0 202 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 ZNF575Q86XF7 245 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 RNF185Q96GF1 192 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC34-201ENST00000317945 GAGE12BA1L429 117 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC34-201ENST00000317945 AP1S3Q96PC3 154 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC34-201ENST00000317945 FCER1GP30273 86 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC34-201ENST00000317945 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC34-201ENST00000317945 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC34-201ENST00000317945 ROS1P08922 2347 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC34-201ENST00000317945 GAGE10A6NGK3 116 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC34-201ENST00000317945 K7ENP7 123 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC34-201ENST00000317945 SNAI2O43623 268 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC34-201ENST00000317945 FOXE3Q13461 319 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC34-201ENST00000317945 SLC50A1Q9BRV3 221 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC34-201ENST00000317945 K7ERU9 68 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC34-201ENST00000317945 ORM1P02763 201 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC34-201ENST00000317945 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CCDC34-201ENST00000317945 TMEM11P17152 192 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC34-201ENST00000317945 Q8TAT8 98 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC34-201ENST00000317945 ZMAT4Q9H898 229 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC34-201ENST00000317945 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC34-201ENST00000317945 PKDREJQ9NTG1 2253 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC34-201ENST00000317945 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC34-201ENST00000317945 FAM90A27PA6NNH2 459 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms