RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299687.9

ZNF407-201, Transcript of zinc finger protein 407, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF407, Length 7,948 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407-201ENST00000299687 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 C1orf43Q9BWL3 253 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 SMKR1H3BMG3 65 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 PRSS29PA6NIE9 313 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 ANGP03950 147 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 MSMBP08118 114 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 RLFQ13129 1914 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 FBLIM1Q8WUP2 373 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa10□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 C14orf132Q9NPU4 83 aa10□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 XCL2Q9UBD3 114 aa10□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 SAA4P35542 130 aa10□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 DKK1O94907 266 aa10□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 WFDC9Q8NEX5 89 aa10□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 FBLN5Q9UBX5 448 aa10□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa10□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 UBE2V1Q13404 147 aa10□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 I3L3M4 83 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 MST1LQ2TV78 715 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 UBE2CO00762 179 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 A0A0G2JNJ9 132 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 TFF1P04155 84 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 IGKV1-13P0DP09 117 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 FGF6P10767 208 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 Q9UFV3 132 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 NDUFC2O95298 119 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 BPESC1Q9GZL8 116 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 SBF2Q86WG5 1849 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 ID3Q02535 119 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 J3QKU1 62 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 IGKV1-5P01602 117 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 AMN1Q8IY45 258 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 SHISA9B4DS77 424 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 MPV17L2Q567V2 206 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 CEP192Q8TEP8 1941 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 NDUFB1O75438 58 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 IGLV3-19P01714 112 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 STPG4Q8N801 248 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 TMEM141Q96I45 108 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 VWA8A3KMH1 1905 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa9.97□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 ANKRD29Q8N6D5 301 aa9.97□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 SRRM5B3KS81 715 aa9.97□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 FOXF2Q12947 444 aa9.97□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.97□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 TIMM17AQ99595 171 aa9.97□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 TMEM131Q92545 1883 aa9.97□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 J3QLI3 93 aa9.97□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.97□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 KNCNA6PVL3 124 aa9.97□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 C4orf51C9J302 202 aa9.97□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 PRR31Q5SQ13 230 aa9.97□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 RNF126Q9BV68 326 aa9.97□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 IGHG2P01859 326 aa9.96□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 PDE6HQ13956 83 aa9.96□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 TREML4Q6UXN2 200 aa9.96□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 GAGE7O76087 117 aa9.96□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 GAGE12FP0CL80 117 aa9.96□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 GAGE12GP0CL81 117 aa9.96□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 GAGE12IP0CL82 117 aa9.96□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 AGMATQ9BSE5 352 aa9.96□□□□□ -0.81
ZNF407-201ENST00000299687 CRYGCP07315 174 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF407-201ENST00000299687 Q71RC1 249 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
ZNF407-201ENST00000299687 VSIRQ9H7M9 311 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF407-201ENST00000299687 ARMS2P0C7Q2 107 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF407-201ENST00000299687 SIGLEC9Q9Y336 463 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF407-201ENST00000299687 H0YJW9 148 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF407-201ENST00000299687 ZNF503Q96F45 646 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF407-201ENST00000299687 CREBBPQ92793 2442 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF407-201ENST00000299687 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
ZNF407-201ENST00000299687 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
ZNF407-201ENST00000299687 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF407-201ENST00000299687 BUB3O43684 328 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF407-201ENST00000299687 C10orf55Q5SWW7 151 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF407-201ENST00000299687 C1orf194Q5T5A4 169 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF407-201ENST00000299687 DLEU1O43261 78 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF407-201ENST00000299687 EFNA2O43921 213 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF407-201ENST00000299687 GREM1O60565 184 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF407-201ENST00000299687 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF407-201ENST00000299687 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms