RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 CD3DP04234 171 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFSF8P32971 234 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 CRYBA4P53673 196 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 MORN5Q5VZ52 161 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 MZT2AQ6P582 158 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 OR51S1Q8NGJ8 323 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM37Q8WXS4 190 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 VGLL1Q99990 258 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB26Q9ULW5 256 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 PXMP4Q9Y6I8 212 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 SMCO3A2RU48 225 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 J3KRW8 73 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 PRAF2O60831 178 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 GYPEP15421 78 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 PPT1P50897 306 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 TCL1AP56279 114 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 IZUMO2Q6UXV1 221 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 WFDC10BQ8IUB3 73 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM229BQ8NBD8 167 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 LHFPL5Q8TAF8 219 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 AP3S1Q92572 193 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM210AQ96ND0 272 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 PRRT1Q99946 306 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 VCX3AQ9NNX9 186 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 MTFP1Q9UDX5 166 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 COX11Q9Y6N1 276 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 E5RGE8 158 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 K7EQD1 137 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 RGS13O14921 159 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 SPINK4O60575 86 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 MPDU1O75352 247 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3-53P01767 116 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00869P0C866 280 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS19P39019 145 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 KIR3DS1Q14943 382 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 GUK1Q16774 197 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 TOR2AQ5JU69 321 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZSA8 131 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 C8orf49Q96NF6 230 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A31Q9H0C2 315 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 Q9HAA7 133 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 C7orf71A4D174 169 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 FABP12A6NFH5 140 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 PMS2P5A8MQ11 134 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 IAPPP10997 89 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 PLP1P60201 277 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 LAGE3Q14657 143 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 NEDD8Q15843 81 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 C4orf46Q504U0 113 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC01556Q5JQF7 62 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 ARV1Q9H2C2 271 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR132Q9UNW8 380 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 WRBO00258 174 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV2-8P01709 118 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 GPX1P07203 203 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A6P12236 298 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 TIRAPP58753 221 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 SPANXN5Q5MJ07 72 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 SCXQ7RTU7 201 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 IQCF2Q8IXL9 164 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 NHLRC2Q8NBF2 726 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 OR52I2Q8NH67 350 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 RMI2Q96E14 147 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 YIPF6Q96EC8 236 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00477Q96M19 166 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 CHAC1Q9BUX1 264 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 ARL6Q9H0F7 186 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 RBFOX3A6NFN3 312 aa5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 GOSR2O14653 212 aa5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-201ENST00000296642 SYNGR2O43760 224 aa5.24□□□□□ -1.57
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