RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 C22orf34Q6ZV56 151 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRN-201ENST00000295718 ASCL5Q7RTU5 278 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRN-201ENST00000295718 LINC00527Q9UJ94 153 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRN-201ENST00000295718 NPYP01303 97 aa11.52□□□□□ -0.56
PTPRN-201ENST00000295718 HTN1P15515 57 aa11.52□□□□□ -0.56
PTPRN-201ENST00000295718 C21orf62Q9NYP8 219 aa11.52□□□□□ -0.56
PTPRN-201ENST00000295718 MSRB1Q9NZV6 116 aa11.52□□□□□ -0.56
PTPRN-201ENST00000295718 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM178BH3BS89 294 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 IGHG3P01860 377 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 CACNA1AO00555 2505 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 PAX2Q02962 417 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 ETDBQ3ZM63 59 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM78Q5T7P6 136 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 SCRT2Q9NQ03 307 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 CIDEAO60543 219 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 CEACAM3P40198 252 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 POU2AF1Q16633 256 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 VKORC1Q9BQB6 163 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 NACAE9PAV3 2078 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 EMP1P54849 157 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 RBPJQ06330 500 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 FAM71F2Q6NXP2 309 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 GLMPQ8WWB7 406 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM158Q8WZ71 300 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 TTC9CQ8N5M4 171 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 TRAV40A0A0B4J280 105 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF479Q96JC4 524 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 JMJD8Q96S16 334 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 DKK4Q9UBT3 224 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 CYSLTR1Q9Y271 337 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 FAM208BQ5VWN6 2430 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 C9orf118A6NHY6 69 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 OR11H12B2RN74 326 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 LTAP01374 205 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 RNF182Q8N6D2 247 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 OR11H1Q8NG94 326 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 OR11H2Q8NH07 326 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 CUL9Q8IWT3 2517 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 NCOR2Q9Y618 2525 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 PSMB2P49721 201 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 OR4X2Q8NGF9 303 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 IGLC1P0CG04 106 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 MYO9AB2RTY4 2548 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 TRBV19A0A075B6N1 114 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 IGKCP01834 107 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 C16orf92Q96LL3 132 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 CTSZQ9UBR2 303 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 SMIM17P0DL12 118 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 UBTD1Q9HAC8 227 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 LHBP01229 141 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 FAM104BQ5XKR9 115 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM238C9JI98 176 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 HAX1O00165 279 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 GP9P14770 177 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 LOXP28300 417 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM30BQ3MIR4 351 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 CLEC19AQ6UXS0 136 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 CHAC1Q9BUX1 264 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 CSTL1Q9H114 145 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF492Q9P255 531 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 DPM3Q9P2X0 92 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 C19orf67A6NJJ6 358 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 MUC6Q6W4X9 2439 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 FABP5P3A8MUU1 101 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 H3BMG7 143 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 IGKV3-20P01619 116 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 PRSS33Q8NF86 280 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 OR9G4Q8NGQ1 327 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 FAM215AQ9Y5M1 114 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 ACACBO00763 2458 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 A0A1B0GXF2 115 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 K7EM74 188 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 NBR2O15453 112 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 DPM2O94777 84 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF883P0CG24 379 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 NDPQ00604 133 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 Q6AWC8 147 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 SH2D6Q7Z4S9 175 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRN-201ENST00000295718 VGLL1Q99990 258 aa11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms