RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 VPREB3Q9UKI3 123 aa8.1□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 K7EN84 100 aa8.1□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 NCR2O95944 276 aa8.1□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa8.1□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF138P52744 262 aa8.1□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 SPATA45Q537H7 98 aa8.1□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.1□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.1□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.1□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.1□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 LEPP41159 167 aa8.1□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.1□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 OR4C46A6NHA9 309 aa8.09□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 PTTG1IPP53801 180 aa8.09□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 SPG11Q96JI7 2443 aa8.09□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 A0A1B0GUS0 222 aa8.09□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 FOLR2P14207 255 aa8.09□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.09□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 OR11H1Q8NG94 326 aa8.09□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 PIEZO1Q92508 2521 aa8.09□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 NMUP48645 174 aa8.09□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.09□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 IGKV1-17P01599 117 aa8.09□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 VGLL1Q99990 258 aa8.09□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 REC114Q7Z4M0 266 aa8.08□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 NDUFA3O95167 84 aa8.08□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 PKIAP61925 76 aa8.08□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.08□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.08□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.08□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.08□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.08□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.08□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 TANC2Q9HCD6 1990 aa8.08□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.08□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.08□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.08□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 NRN1Q9NPD7 142 aa8.08□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 HCFC1P51610 2035 aa8.08□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 LINC01619G3V211 115 aa8.08□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 Q6AWC8 147 aa8.08□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 ORMDL3Q8N138 153 aa8.08□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.08□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 SPEGQ15772 3267 aa8.08□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 SMKR1H3BMG3 65 aa8.07□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 CTSGP08311 255 aa8.07□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF502Q8TBZ5 544 aa8.07□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.07□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.07□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 NDUFA4O00483 81 aa8.07□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 PDE6HQ13956 83 aa8.07□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 FAM209BQ5JX69 171 aa8.07□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.07□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 ACACBO00763 2458 aa8.07□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 V9GYV3 84 aa8.07□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 MYO15AQ9UKN7 3530 aa8.07□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 C5orf52A6NGY3 159 aa8.07□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 F6UB75 175 aa8.07□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 TRBV12-3P01733 135 aa8.07□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa8.07□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 CFHR4Q92496 578 aa8.07□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 C7orf71A4D174 169 aa8.06□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 D6R8Y8 96 aa8.06□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 LY6LH3BQJ8 138 aa8.06□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 UBE2CO00762 179 aa8.06□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 DEFB131AP59861 70 aa8.06□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 WFDC11Q8NEX6 87 aa8.06□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.06□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 NIT1Q86X76 327 aa8.06□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 IFITM10A6NMD0 228 aa8.06□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 G0S2P27469 103 aa8.06□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.06□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.06□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 VPS13AQ96RL7 3174 aa8.06□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.06□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.06□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM213A2RRL7 107 aa8.06□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 GP9P14770 177 aa8.06□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.06□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.05□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 SLURP1P55000 103 aa8.05□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.05□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.05□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.05□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 CHD8Q9HCK8 2581 aa8.05□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.05□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 A0A1B0GW15 77 aa8.05□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.05□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 LINC00477Q96M19 166 aa8.05□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.05□□□□□ -1.12
TTPAL-201ENST00000262605 KRTAP10-9P60411 292 aa8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms