RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC35G3	Q8N808	338 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	ARL11	Q969Q4	196 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	PAXX	Q9BUH6	204 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	ROS1	P08922	2347 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM218	A2RU14	115 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	C19orf84	I3L1E1	186 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	HAND1	O96004	215 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	REG1A	P05451	166 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF224	P0DH78	156 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	DEFA5	Q01523	94 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	BSPH1	Q075Z2	132 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	BTN1A1	Q13410	526 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM86B	Q8N661	226 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC01560	Q8TB33	94 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616		Q8WTZ3	238 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM104A	Q969W3	186 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	MMP26	Q9NRE1	261 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	PSG11	Q9UQ72	335 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SPG11	Q96JI7	2443 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	MED6	O75586	246 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV2-23	P01705	113 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV3-13	P01766	116 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SEC11B	P0C7V7	166 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A6	P12236	298 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	FOLR2	P14207	255 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	COX6B1	P14854	86 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	CD200	P41217	278 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB5C	P51148	216 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF83	P51522	516 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	PRNT	Q86SH4	94 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF329	Q86UD4	541 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	DRAM1	Q8N682	238 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	GALM	Q96C23	342 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	FXYD5	Q96DB9	178 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	C18orf15	Q96N68	181 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	GINS3	Q9BRX5	216 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	HES4	Q9HCC6	221 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	PARP11	Q9NR21	331 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SMPX	Q9UHP9	88 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A0U1RQV1	116 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616		F8W036	122 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	UPK2	O00526	184 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SSSCA1	O60232	199 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	ATG12	O94817	140 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	PRH1	P02810	166 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00614	P0C842	121 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	PSG2	P11465	335 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	AKR1C2	P52895	323 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	AKR1C1	Q04828	323 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	HMGN3	Q15651	99 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	NMS	Q5H8A3	153 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616		Q6ZR03	302 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SVBP	Q8N300	66 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	OR51H1	Q8NH63	302 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR146	Q96CH1	333 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	WFDC1	Q9HC57	220 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	AKAP9	Q99996	3911 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	PDZD2	O15018	2839 aa		3.53	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms