RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATOH7Q8N100 152 aa9.25□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF414Q96IQ9 312 aa9.25□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VAMP8Q9BV40 100 aa9.25□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABCA2Q9BZC7 2435 aa9.24□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGSF10Q6WRI0 2623 aa9.24□□□□□ -0.93
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MFAP4P55083 255 aa9.24□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGFL4Q6B9Z1 124 aa9.24□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMIM12Q96EX1 92 aa9.24□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BPESC1Q9GZL8 116 aa9.24□□□□□ -0.93
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa9.24□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q8N6K4 173 aa9.24□□□□□ -0.93
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TTC9CQ8N5M4 171 aa9.23□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.23□□□□□ -0.93
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C2orf88Q9BSF0 95 aa9.23□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.23□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TPPP3Q9BW30 176 aa9.23□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PSG8Q9UQ74 426 aa9.23□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC01548A6NM66 108 aa9.22□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAJINQ3KP22 176 aa9.22□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa9.22□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.22□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q8N9W7 124 aa9.22□□□□□ -0.93
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POLQO75417 2590 aa9.22□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CTSGP08311 255 aa9.22□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF138P52744 262 aa9.22□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ECSCRQ19T08 205 aa9.22□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa9.21□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NPIPB6E9PJ23 425 aa9.21□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 M0R2Z0 102 aa9.21□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GNLYP22749 145 aa9.21□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SAA4P35542 130 aa9.21□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BORCS7Q96B45 105 aa9.21□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa9.21□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PSG3Q16557 428 aa9.21□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CT83Q5H943 113 aa9.21□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EBLN2Q6P2I7 272 aa9.21□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.21□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1RLQ9NZP8 487 aa9.21□□□□□ -0.93
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa9.21□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OVOL3O00110 214 aa9.21□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARMS2P0C7Q2 107 aa9.21□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HLA-DMBP28068 263 aa9.21□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EFNA4P52798 201 aa9.21□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EBI3Q14213 229 aa9.21□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MINOS1Q5TGZ0 78 aa9.21□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.21□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa9.21□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM208BQ5VWN6 2430 aa9.2□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa9.2□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa9.2□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MUC21A0A140T8X8 626 aa9.2□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 G3V318 75 aa9.2□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LMO4P61968 165 aa9.2□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF124Q15973 351 aa9.2□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MUC21Q5SSG8 566 aa9.2□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.2□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.2□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZANQ9Y493 2812 aa9.2□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa9.2□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa9.2□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHEK1O14757 476 aa9.2□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 APOHP02749 345 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM106CPP0CH98 169 aa9.2□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPR183P32249 361 aa9.2□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C15orf32Q32M92 178 aa9.2□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM75Q8N9X5 138 aa9.2□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 THYN1Q9P016 225 aa9.2□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa9.19□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.19□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 M0R143 59 aa9.19□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATP6V0E1O15342 81 aa9.19□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPATA45Q537H7 98 aa9.19□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa9.19□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC00173Q6ZV60 143 aa9.19□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.19□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AAMDCQ9H7C9 122 aa9.19□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNF24Q9Y225 148 aa9.19□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 K7EQM0 130 aa9.19□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CSN3P07498 182 aa9.19□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAB4AP20338 218 aa9.19□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPATA12Q7Z6I5 190 aa9.19□□□□□ -0.94
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q8TAT8 98 aa9.19□□□□□ -0.94
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