RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 LINC00312Q9Y6C7 94 aa8.58□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 A6NDN8 102 aa8.57□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 KIR3DS1Q14943 382 aa8.57□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.57□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.57□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.57□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 OSTCQ9NRP0 149 aa8.57□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 C1RLQ9NZP8 487 aa8.57□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 A0A0G2JNJ9 132 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 C17orf100A8MU93 164 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 Q9UFV3 132 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 A0A1W2PPI3 338 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 TNFRSF1AP19438 455 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 CTSZQ9UBR2 303 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 A0A1W2PPM0 123 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 A0A1W2PRE2 83 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 Q71RC1 249 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 SSX8Q7RTT4 187 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 OR4C13Q8NGP0 309 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 MRAP2Q96G30 205 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 PGPA6NDG6 321 aa8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 C16orf97H3BN30 126 aa8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 PEX7O00628 323 aa8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 COX8AP10176 69 aa8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 IGFL3Q6UXB1 125 aa8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF329Q86UD4 541 aa8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 NUP35Q8NFH5 326 aa8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 HIGD1CA8MV81 97 aa8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 NDUFB3O43676 98 aa8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 LEPROTL1O95214 131 aa8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF137PP52743 207 aa8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 Q6ZS92 163 aa8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 OR5AN1Q8NGI8 311 aa8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF479Q96JC4 524 aa8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.54□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 TEX36Q5VZQ5 186 aa8.54□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 DYNLRB1Q9NP97 96 aa8.54□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 ABCA2Q9BZC7 2435 aa8.54□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.54□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM189A5PLL7 270 aa8.54□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 VWC2LB2RUY7 222 aa8.54□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 COX7A1P24310 79 aa8.54□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 FXYD5Q96DB9 178 aa8.54□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.54□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM178BH3BS89 294 aa8.54□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM177Q53S58 311 aa8.54□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.54□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 S4R3C0 116 aa8.54□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 IGLV2-23P01705 113 aa8.53□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 THBDP07204 575 aa8.53□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 FABP2P12104 132 aa8.53□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 PDPNQ86YL7 162 aa8.53□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 FAM57AQ8TBR7 257 aa8.53□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 SPATA25Q9BR10 227 aa8.53□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 C19orf24Q9BVV8 132 aa8.53□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.53□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 CUBNO60494 3623 aa8.53□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 A0A1W2PRD5 423 aa8.53□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 A0A1W2PRF3 423 aa8.53□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 A0A1W2PRM7 423 aa8.53□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 FAM90A27PA6NNH2 459 aa8.53□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 FNDC10F2Z333 226 aa8.53□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 GFRALQ6UXV0 394 aa8.53□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 FA2HQ7L5A8 372 aa8.53□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.53□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 GATA3P23771 443 aa8.52□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.52□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.52□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.52□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 RABAC1Q9UI14 185 aa8.52□□□□□ -1.04
FCHO1-216ENST00000596536 PRRG2O14669 202 aa8.52□□□□□ -1.05
FCHO1-216ENST00000596536 LOXP28300 417 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
FCHO1-216ENST00000596536 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.52□□□□□ -1.05
FCHO1-216ENST00000596536 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.52□□□□□ -1.05
FCHO1-216ENST00000596536 PRB1P04280 392 aa8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms