RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591833.5

SEPT9-240, Transcript of septin 9, human

TSL 4

Gene SEPT9, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEPT9-240	ENST00000591833	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	RNF141	Q8WVD5	230 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	ZFP92	A6NM28	416 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	HLA-DRB4	P13762	266 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	DLK1	P80370	383 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	GAMT	Q14353	236 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	VWC2	Q2TAL6	325 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	SLC35E1	Q96K37	410 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	WFDC1	Q9HC57	220 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	UMAD1	C9J7I0	102 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	MPDU1	O75352	247 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	ID1	P41134	155 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833		Q6ZTC4	211 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	NEU1	Q99519	415 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	SULT1A2	P50226	295 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	TMED6	Q8WW62	240 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	TRGV9	Q99603	122 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	MED9	Q9NWA0	146 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	XCL2	Q9UBD3	114 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SEPT9-240	ENST00000591833	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	TMEM189	A5PLL7	270 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	NMB	P08949	121 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	PSMB3	P49720	205 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	BLOC1S1	P78537	153 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	SERF2	P84101	59 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	PRR20E	P86478	221 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	PRR20C	P86479	221 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	PRR20D	P86480	221 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	PRR20B	P86481	221 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	PRR20A	P86496	221 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	ZNF90	Q03938	601 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	ARL16	Q0P5N6	197 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	LINC00862	A6NCI5	91 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	PRSS46	E5RG02	174 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	AMBP	P02760	352 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	ATP6V0C	P27449	155 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	C12orf74	Q32Q52	190 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	THAP8	Q8NA92	274 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	ISLR	O14498	428 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	S100A7	P31151	101 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	MEOX2	P50222	304 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	LYZ	P61626	148 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	RAB31	Q13636	194 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	ZNF709	Q8N972	641 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	LINC00052	Q96N35	136 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	CELA1	Q9UNI1	258 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	SOCS3	O14543	225 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	MB	P02144	154 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	FGF7	P21781	194 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833		P0DMU3	169 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	FAM231A	P0DMU4	169 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	FAM231C	P0DMU5	169 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	TEPP	Q6URK8	271 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	FAM210B	Q96KR6	192 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	RPRM	Q9NS64	109 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	RFNG	Q9Y644	331 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	SMCO3	A2RU48	225 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SEPT9-240	ENST00000591833	TEX46	H3BTG2	121 aa		10.22	□□□□□ -0.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms