RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 MARC2Q969Z3 335 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM230Q96A57 120 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 SRRQ9GZT4 340 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 DNAH3Q8TD57 4116 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A0B4J2A0 478 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 I3L2K1 104 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 K7EIM0 57 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 K7EMT4 169 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 NDUFA4O00483 81 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 TGOLN2O43493 480 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 MT-CO2P00403 227 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 C8orf88P0DMB2 117 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 CT45A10P0DMU9 189 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 CCR6P51684 374 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 Q56UQ5 140 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIQKQ629K1 86 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 LCN12Q6JVE5 192 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00299Q6ZSB3 139 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 LYZL2Q7Z4W2 148 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 LHFPL5Q8TAF8 219 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 ISOC2Q96AB3 205 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 SHPKQ9UHJ6 478 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A0G2JRQ6 117 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1B0GU03 582 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 OR2T8A6NH00 312 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 PMS2P5A8MQ11 134 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 CEBPZOSA8MTT3 80 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 CORTO00230 105 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 SFT2D2O95562 160 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 SULT1A3P0DMM9 295 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 SULT1A4P0DMN0 295 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 CTAG1AP78358 180 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 SPINK9Q5DT21 86 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 TMED4Q7Z7H5 227 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 UBAC2Q8NBM4 344 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 DYNLRB2Q8TF09 96 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 CACNG5Q9UF02 275 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 TGP01266 2768 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM231BA6NCW3 169 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 IZUMO1RA6ND01 250 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 BUB3O43684 328 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 GNG7O60262 68 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 SMCO1Q147U7 214 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 GUCA2BQ16661 112 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 C2orf83Q53S99 150 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 OCR1Q9BZK8 76 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 TUBA4BQ9H853 241 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 U3KQ87 197 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1B0GUV1 79 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM213A2RRL7 107 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 A8MWP6 167 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 MED6O75586 246 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 YIF1AO95070 293 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 NDUFB6O95139 128 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 IFNA10P01566 189 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV3-48P01763 117 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC25A6P12236 298 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 IL7P13232 177 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 BSXQ3C1V8 233 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 NMSQ5H8A3 153 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 SBSPONQ8IVN8 264 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 OR4X1Q8NH49 305 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 OR1S1Q8NH92 325 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 SMPXQ9UHP9 88 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 C9orf170A2RU37 121 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 PLA2G10O15496 165 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 PITX3O75364 302 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 IFNA21P01568 189 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 CD5P06127 495 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 OR4E1P0C645 316 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC25A4P12235 298 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-216ENST00000590105 OPRK1P41145 380 aa5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms