RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589706.1

SMAD4-208, Transcript of SMAD family member 4, human

TSL 3

Gene SMAD4, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD4-208	ENST00000589706	ZIC1	Q15915	447 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	TNXA	Q16473	311 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	OTP	Q5XKR4	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	ZNF695	Q8IW36	515 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	ZNF525	Q8N782	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	FADS6	Q8N9I5	356 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	RPE	Q96AT9	228 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	TG	P01266	2768 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706		A0A1B0GTH9	108 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706		A0A1B0GWA3	101 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	CHST1	O43916	411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	DHRS3	O75911	302 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	C1orf105	O95561	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	BGLAP	P02818	100 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	MT-ATP8	P03928	68 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	C8orf88	P0DMB2	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	PRTN3	P24158	256 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	KIR2DS2	P43631	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	XG	P55808	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	TMEM50B	P56557	158 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	TAS2R45	P59539	299 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	GNB1	P62873	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	TFF3	Q07654	80 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	WFDC2	Q14508	124 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	NMS	Q5H8A3	153 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	LINC01545	Q5VT33	79 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	STH	Q8IWL8	128 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	PIFO	Q8TCI5	191 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	NUS1	Q96E22	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	AMELY	Q99218	206 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706		A0A0A6YYD4	124 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	TSHB	P01222	138 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	ORM1	P02763	201 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	FGF6	P10767	208 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	NPPC	P23582	126 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	RHOA	P61586	193 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	PPP1CA	P62136	330 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	ATP5G2	Q06055	141 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	GTF3C1	Q12789	2109 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	TAL2	Q16559	108 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	OR51H1	Q8NH63	302 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	C8orf44	Q96CB5	159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMAD4-208	ENST00000589706	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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