RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 LINC01559Q495D7 138 aa6.36□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.36□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 MOB3BQ86TA1 216 aa6.36□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 ZNF329Q86UD4 541 aa6.36□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 BAGE3Q86Y29 109 aa6.36□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.36□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.36□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.36□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 MS4A10Q96PG2 267 aa6.36□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.36□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 EPDR1Q9UM22 224 aa6.36□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 HSPG2P98160 4391 aa6.36□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 LINC00587B1AMM8 73 aa6.35□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 LY6LH3BQJ8 138 aa6.35□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 K7EN84 100 aa6.35□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.35□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 DEFA4P12838 97 aa6.35□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 PMCHP20382 165 aa6.35□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 SSTP61278 116 aa6.35□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.35□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.35□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.35□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 OR5T1Q8NG75 326 aa6.35□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.35□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 FXYD5Q96DB9 178 aa6.35□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 MISP3Q96FF7 219 aa6.35□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 KCNS1Q96KK3 526 aa6.35□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.35□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.35□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.35□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.35□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 ZNF253O75346 499 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 FOXH1O75593 365 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 OR2J3O76001 311 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 NDUFB8O95169 186 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 CNIH1O95406 144 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 LTAP01374 205 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 APCSP02743 223 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 RD3LP0DJH9 198 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 REG1BP48304 166 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 PSG9Q00887 426 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 PMCHL1Q16048 86 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.34□□□□□ -1.39
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GGA3-218ENST00000584243 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 BORCS7Q96B45 105 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 ZNF503Q96F45 646 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 NAGKQ9UJ70 344 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 CGB1A6NKQ9 187 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 A8MWP6 167 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 ODF3BA8MYP8 253 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 TEX22C9J3V5 150 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 P01737 135 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 TCRAP04437 139 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 OR5AL1P0C617 328 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 IGLC1P0CG04 106 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 FAM106CPP0CH98 169 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 GP9P14770 177 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 ADMP35318 185 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 IER3P46695 156 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 CSN1S1P47710 185 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 HBBP68871 147 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 MMDQ15546 238 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 PSMG4Q5JS54 123 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 LPAR2Q9HBW0 351 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 I3L2K1 104 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 SCGB1D1O95968 90 aa6.32□□□□□ -1.4
GGA3-218ENST00000584243 FSHBP01225 129 aa6.32□□□□□ -1.4
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