RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583841.1

TSPOAP1-AS1-210, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSPOAP1-AS1, Length 840 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 STAG3L2P0CL84 134 aa11.72□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 STAG3L3P0CL85 134 aa11.72□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ARL14EPLP0DKL9 152 aa11.72□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MEOX2P50222 304 aa11.72□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LCN15Q6UWW0 184 aa11.72□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LRRC20Q8TCA0 184 aa11.72□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 BLNKQ8WV28 456 aa11.72□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RNF141Q8WVD5 230 aa11.72□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FXYD5Q96DB9 178 aa11.72□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PHYHIPLQ96FC7 376 aa11.72□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 C16orf92Q96LL3 132 aa11.72□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 UBQLN2Q9UHD9 624 aa11.72□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa11.71□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SLC17A3O00476 420 aa11.71□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SOCS3O14543 225 aa11.71□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF688P0C7X2 276 aa11.71□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SULT1A2P50226 295 aa11.71□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IGFL4Q6B9Z1 124 aa11.71□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DPPA3Q6W0C5 159 aa11.71□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PQLC2Q6ZP29 291 aa11.71□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IQCF2Q8IXL9 164 aa11.71□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa11.71□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TRBV19A0A075B6N1 114 aa11.7□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NBEAP1P0C6P0 100 aa11.7□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RAB5CP51148 216 aa11.7□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GUK1Q16774 197 aa11.7□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ODF3L2Q3SX64 289 aa11.7□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 WFDC10AQ9H1F0 79 aa11.7□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MAP6D1Q9H9H5 199 aa11.7□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa11.69□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ISLRO14498 428 aa11.69□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CXorf1O96002 111 aa11.69□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HLA-DMBP28068 263 aa11.69□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GCHFRP30047 84 aa11.69□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ID1P41134 155 aa11.69□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PSMB3P49720 205 aa11.69□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DEFB131AP59861 70 aa11.69□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PSMG4Q5JS54 123 aa11.69□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SAMD13Q5VXD3 122 aa11.69□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 Q8N1Y9 231 aa11.69□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RNF182Q8N6D2 247 aa11.69□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LINC00052Q96N35 136 aa11.69□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa11.68□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 A0A1B0GV50 99 aa11.68□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 OR11H12B2RN74 326 aa11.68□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NDUFB4O95168 129 aa11.68□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 APRG1Q8IVJ8 170 aa11.68□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SFT2D1Q8WV19 159 aa11.68□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 C20orf173Q96LM9 149 aa11.68□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SLC50A1Q9BRV3 221 aa11.68□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 C19orf73Q9NVV2 129 aa11.68□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 AGRNO00468 2067 aa11.67□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF253O75346 499 aa11.67□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 H2AFB1P0C5Y9 115 aa11.67□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PDE6HQ13956 83 aa11.67□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF124Q15973 351 aa11.67□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TEX261Q6UWH6 196 aa11.67□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DEFB125Q8N687 156 aa11.67□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MBD3L1Q8WWY6 194 aa11.67□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa11.67□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DEFB1P60022 68 aa11.66□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RANP62826 216 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PSG9Q00887 426 aa11.66□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa11.66□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TMEM167BQ9NRX6 74 aa11.66□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF738Q8NE65 137 aa11.65□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF680Q8NEM1 530 aa11.65□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FAM110AQ9BQ89 295 aa11.65□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 AAMDCQ9H7C9 122 aa11.65□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 K7EIL1 84 aa11.64□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ICAM4Q14773 271 aa11.64□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PSG3Q16557 428 aa11.64□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SUN5Q8TC36 379 aa11.64□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 Q9H3A6 140 aa11.64□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SRD5A3Q9H8P0 318 aa11.64□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KNCNA6PVL3 124 aa11.63□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 F6UB75 175 aa11.63□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 M0R3E3 92 aa11.63□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IFNA7P01567 189 aa11.63□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa11.63□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 UBE2G2P60604 165 aa11.63□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ACTL10Q5JWF8 245 aa11.63□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CITED4Q96RK1 184 aa11.63□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TEX46H3BTG2 121 aa11.62□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HBE1P02100 147 aa11.62□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CCL20P78556 96 aa11.62□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DEFA6Q01524 100 aa11.62□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GDF5OSQ5U4N7 250 aa11.62□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LYPD1Q8N2G4 141 aa11.62□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms