RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	NDUFA3	O95167	84 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	LTA	P01374	205 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289		P01737	135 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	TCRA	P04437	139 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	GPX1	P07203	203 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	OR5AL1	P0C617	328 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	IGLC1	P0CG04	106 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	MYOD1	P15172	320 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	PAX1	P15863	534 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	GNLY	P22749	145 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	PCP4	P48539	62 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	SST	P61278	116 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	EBI3	Q14213	229 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	FXYD3	Q14802	87 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	MMD	Q15546	238 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	PMCHL1	Q16048	86 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	UTF1	Q5T230	341 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	HCP5	Q6MZN7	132 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	DUX5	Q96PT3	197 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	NAGK	Q9UJ70	344 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	VCAN	P13611	3396 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ODF3B	A8MYP8	253 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	TEX22	C9J3V5	150 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289		E7EUB6	86 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	TIMM23	O14925	209 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	FCN3	O75636	299 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	OR2J3	O76001	311 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	IGLV2-8	P01709	118 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	CT45A10	P0DMU9	189 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	HNF1A	P20823	631 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	CBLN1	P23435	193 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	COX7A1	P24310	79 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	AMT	P48728	403 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	UBE2E1	P51965	193 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	EFNA4	P52798	201 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	MFAP2	P55001	183 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ARF6	P62330	175 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	HBB	P68871	147 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	RIG	Q13278	110 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	OR5I1	Q13606	314 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	HES1	Q14469	280 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	KLK9	Q2XQG4	91 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	PSMG4	Q5JS54	123 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289		Q9H3A6	140 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	FBXL15	Q9H469	300 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	APC2	O95996	2303 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ROS1	P08922	2347 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289		M0R143	59 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	CHEK1	O14757	476 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	HSBP1	O75506	76 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	SERF1A	O75920	110 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	GAS8-AS1	O95177	125 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	PYY	P10082	97 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	GP9	P14770	177 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	BMI1	P35226	326 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	LYZ	P61626	148 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PTPRM-215	ENST00000583289	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		3.53	□□□□□ -1.84

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