RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 BLOC1S1P78537 153 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 LCN15Q6UWW0 184 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 UBQLN2Q9UHD9 624 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 NOTCH1P46531 2555 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 OR4C46A6NHA9 309 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 HBE1P02100 147 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 GCHFRP30047 84 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 IFITM2Q01629 132 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 PMS2P11Q13670 270 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.62□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 TEX46H3BTG2 121 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 ISLRO14498 428 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 NDUFB4O95168 129 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 OR10J4P0C629 311 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 PSMB3P49720 205 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 ZNF767PQ75MW2 155 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 GBGT1Q8N5D6 347 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.61□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.6□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 G3V4G9 280 aa8.6□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 SLC17A3O00476 420 aa8.6□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 ID1P41134 155 aa8.6□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 PSG9Q00887 426 aa8.6□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 GUCA2BQ16661 112 aa8.6□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.6□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 A0A1W2PRE2 83 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 TFPI2P48307 235 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 PPT1P50897 306 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 BLNKQ8WV28 456 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 C16orf92Q96LL3 132 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 H3BTX0 84 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 RGS13O14921 159 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 NMBP08949 121 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP10-11P60412 298 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 FAM24BQ8N5W8 94 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 PRELID1Q9Y255 219 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 RANP62826 216 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 CCL20P78556 96 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 PSG3Q16557 428 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 Q9H3A6 140 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 MANBALQ9NQG1 85 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 OTORQ9NRC9 128 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 A0A1B0GV50 99 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 FAM74A7A6NL05 159 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 CD7P09564 240 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 ZNF688P0C7X2 276 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 RAB14P61106 215 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 CLLU1Q5K131 121 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 Q8N1Y9 231 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 C20orf173Q96LM9 149 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 OR11H12B2RN74 326 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 GGTLC3B5MD39 225 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 DEFB131AP59861 70 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 CD81P60033 236 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 ICAM4Q14773 271 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 PSMG4Q5JS54 123 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-211ENST00000582232 RNF182Q8N6D2 247 aa8.55□□□□□ -1.04
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