RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 K7EP13 123 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 K7EP34 96 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 NPFFO15130 113 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 DNAL4O96015 105 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 FXYD5Q96DB9 178 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 DEFB125Q8N687 156 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 MRAP2Q96G30 205 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 YAE1D1Q9NRH1 226 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 NUPR1O60356 82 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 PRR31Q5SQ13 230 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 IGLV1-44P01699 117 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 JMJD8Q96S16 334 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 PIMREGQ9BSJ6 248 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 NCOR1O75376 2440 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 UBE2L6O14933 153 aa8.36□□□□□ -1.07
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PTPRM-205ENST00000577827 ERG28Q9UKR5 140 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM238C9JI98 176 aa8.36□□□□□ -1.07
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PTPRM-205ENST00000577827 ZNF134P52741 427 aa8.36□□□□□ -1.07
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PTPRM-205ENST00000577827 YPEL4Q96NS1 127 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 WT1-ASQ06250 92 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.35□□□□□ -1.07
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PTPRM-205ENST00000577827 GAGE2BQ13066 116 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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PTPRM-205ENST00000577827 RNF182Q8N6D2 247 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 M0R1W7 72 aa8.34□□□□□ -1.07
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PTPRM-205ENST00000577827 TAL2Q16559 108 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM155Q4W5P6 130 aa8.34□□□□□ -1.07
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PTPRM-205ENST00000577827 C15orf32Q32M92 178 aa8.34□□□□□ -1.07
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PTPRM-205ENST00000577827 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 FXYD7P58549 80 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 Q5PR19 223 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 TEX36Q5VZQ5 186 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
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PTPRM-205ENST00000577827 K7EM74 188 aa8.34□□□□□ -1.07
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PTPRM-205ENST00000577827 ZNF747Q9BV97 191 aa8.33□□□□□ -1.08
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PTPRM-205ENST00000577827 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 PKDREJQ9NTG1 2253 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 TDRG1Q3Y452 100 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 C11orf53Q8IXP5 236 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-205ENST00000577827 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.32□□□□□ -1.08
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