RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559257.5

USP3-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5

Gene USP3, Length 2,217 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-211ENST00000559257 H7C1H1 209 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 DLL1O00548 723 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 PEX7O00628 323 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 MYCNOSP40205 109 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 HES3Q5TGS1 186 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 C5orf38Q86SI9 138 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 U3KQK5 164 aa6.69□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 P0DMU3 169 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 FAM231AP0DMU4 169 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 FAM231CP0DMU5 169 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 CRYGSP22914 178 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 LINC00643Q86TS7 51 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 LINC00311Q8N616 119 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 IL17DQ8TAD2 202 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 AGRNO00468 2067 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 DKK1O94907 266 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 PYYP10082 97 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 ZNF137PP52743 207 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 SLC25A45Q8N413 288 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 LYZL4Q96KX0 146 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 LINC01546A6NGU7 62 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 STATHP02808 62 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 CD164Q04900 197 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 RIGQ13278 110 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 PIGYQ3MUY2 71 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 UPK3BQ9BT76 320 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 CCL8P80075 99 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 BMFQ96LC9 184 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 PRSS46E5RG02 174 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 P01737 135 aa6.66□□□□□ -1.34
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USP3-211ENST00000559257 PRR20CP86479 221 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 PRR20DP86480 221 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 PRR20BP86481 221 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 PRR20AP86496 221 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 ATXN8Q156A1 80 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 DYSFO75923 2080 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 PGPA6NDG6 321 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 H3BT86 120 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 IGLV2-14P01704 120 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 LINC01620Q4KN68 170 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 TMEM92Q6UXU6 159 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 WDR31Q8NA23 367 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 NABP2Q9BQ15 211 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-211ENST00000559257 A0A1B0GUT8 65 aa6.65□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 A0A1W2PRU2 124 aa6.65□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 TNFRSF4P43489 277 aa6.65□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 HERVK_113P61574 105 aa6.65□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.65□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.65□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 C16orf95Q9H693 158 aa6.65□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 RETNQ9HD89 108 aa6.65□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 HSPB6O14558 160 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 ZNF883P0CG24 379 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 NPC2P61916 151 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 CDSNQ15517 529 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 MDP1Q86V88 176 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 SERP2Q8N6R1 65 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 LTBP2Q14767 1821 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-211ENST00000559257 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.64□□□□□ -1.35
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