RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553876.2

RBM23-208, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 267 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-208	ENST00000553876	TCTA	P57738	103 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	GKN2	Q86XP6	184 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876		Q8TAT8	98 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	GID8	Q9NWU2	228 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	PRDM2	Q13029	1718 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	ODAM	A1E959	279 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	OR2T8	A6NH00	312 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM238	C9JI98	176 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876		H3BRM9	83 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876		K7ERJ3	54 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	KLRD1	Q13241	179 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	MSMO1	Q15800	293 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	NUP35	Q8NFH5	326 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	HYLS1	Q96M11	299 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	PRRT1	Q99946	306 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	CD109	Q6YHK3	1445 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	PIK3C2A	O00443	1686 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876		E5RI56	91 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	RER1	O15258	196 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	HIST1H2BK	O60814	126 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	CSN2	P05814	226 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	COX7C	P15954	63 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	GRINA	Q7Z429	371 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	OR5AS1	Q8N127	324 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	STX19	Q8N4C7	294 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	HMGXB3	Q12766	1538 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	MED12	Q93074	2177 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	G0S2	P27469	103 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	CROCCP2	Q86T23	111 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	BIN3	Q9NQY0	253 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	ASB4	Q9Y574	426 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	CIT	O14578	2027 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	hDV103S1	A0JD37	113 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	PIAS1	O75925	651 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	GLRX	P35754	106 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	RTL8B	Q17RB0	113 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	LRRC18	Q8N456	261 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876		Q8N6K4	173 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	PTPRD	P23468	1912 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	SYNM	O15061	1565 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	SMARCA2	P51531	1590 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	FBN2	P35556	2912 aa		0.9	□□□□□ -2.26
RBM23-208	ENST00000553876	GPR31	O00270	319 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM23-208	ENST00000553876	SERPINB1	P30740	379 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM23-208	ENST00000553876	GNG10	P50151	68 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM23-208	ENST00000553876	EFNA4	P52798	201 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM23-208	ENST00000553876	CRYBA4	P53673	196 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM23-208	ENST00000553876	VBP1	P61758	197 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM23-208	ENST00000553876	HBB	P68871	147 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM23-208	ENST00000553876	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
RBM23-208	ENST00000553876	LTC4S	Q16873	150 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM23-208	ENST00000553876	TRIQK	Q629K1	86 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM23-208	ENST00000553876	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM23-208	ENST00000553876	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM23-208	ENST00000553876	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM23-208	ENST00000553876	NEK7	Q8TDX7	302 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM23-208	ENST00000553876	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM23-208	ENST00000553876	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM23-208	ENST00000553876	MED11	Q9P086	117 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RBM23-208	ENST00000553876	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		0.9	□□□□□ -2.27

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