RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 FN1P02751 2386 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 A0A087X0K7 114 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 A0A1B0GUS0 222 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 SLC17A3O00476 420 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 BMI1P35226 326 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 PDE6HQ13956 83 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 FAM74A3Q4VXF1 159 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 LYPD1Q8N2G4 141 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 AAMDCQ9H7C9 122 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 SMPXQ9UHP9 88 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRR-209ENST00000549308 M0R036 132 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 PEX7O00628 323 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 SNAPINO95295 136 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 MYCNOSP40205 109 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 AKR1C3P42330 323 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 GNG5P63218 68 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 PSG9Q00887 426 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 CMTM2Q8TAZ6 248 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 TVP23CQ96ET8 276 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 TCEAL7Q9BRU2 100 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 EPDR1Q9UM22 224 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM213A2RRL7 107 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 A8MWP6 167 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 CHEK1O14757 476 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF253O75346 499 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 EDN2P20800 178 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 MEOX2P50222 304 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 C5orf17Q8NAS9 161 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 HIST1H2BAQ96A08 127 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 DERL1Q9BUN8 251 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 NAT8Q9UHE5 227 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 HELTA6NFD8 242 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 CNN1P51911 297 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 RPL11P62913 178 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 FOXL1Q12952 345 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 RAX2Q96IS3 184 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 PEMTQ9UBM1 199 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 F8P00451 2351 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 C2orf70A6NJV1 201 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 M0QZ24 198 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 CCL24O00175 119 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 RPL35P42766 123 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 ATRAIDQ6UW56 229 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 TCF24Q7RTU0 167 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 C2CD4CQ8TF44 421 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 ATG101Q9BSB4 218 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 SDF2L1Q9HCN8 221 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 TCRAP04437 139 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 CSN1S1P47710 185 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 KRTAP10-3P60369 221 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 UBE2G1P62253 170 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 ADIRFQ15847 76 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 AWAT1Q58HT5 328 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 IGFL4Q6B9Z1 124 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 SELENOKQ9Y6D0 94 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 SCO1O75880 301 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 FOLR2P14207 255 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 CBLN1P23435 193 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 HLA-DMBP28068 263 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 OR9G4Q8NGQ1 327 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 C16orf92Q96LL3 132 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 TRAV34A0A0B4J273 112 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 M0R3E3 92 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 GNG4P50150 75 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 TAS2R60P59551 318 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 FHL3Q13643 280 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 CENPWQ5EE01 88 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 LINC00479Q96M42 142 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 NRN1Q9NPD7 142 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 RPS10P5Q9NQ39 176 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 PRELID1Q9Y255 219 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 PGPEP1LA6NFU8 196 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 C9JCJ5 164 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 DIRC3C9JPN6 131 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 K7EQM0 130 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 RHEBQ15382 184 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 RNF182Q8N6D2 247 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRR-209ENST00000549308 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 216.7 ms