RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547715.1

PTPRB-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-205ENST00000547715 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
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PTPRB-205ENST00000547715 HELTA6NFD8 242 aa10.3□□□□□ -0.76
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PTPRB-205ENST00000547715 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
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PTPRB-205ENST00000547715 HBE1P02100 147 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRB-205ENST00000547715 HLA-DRB4P13762 266 aa10.23□□□□□ -0.77
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PTPRB-205ENST00000547715 PHLDA2Q53GA4 152 aa10.23□□□□□ -0.77
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