RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546585.1

CS-203, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,803 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-203ENST00000546585 LTAP01374 205 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 TRBV12-3P01733 135 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 TRGC2P03986 189 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 CLEC3BP05452 202 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 HIST1H2BJP06899 126 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 HIST1H2BOP23527 126 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 GPR183P32249 361 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 HIST1H2BBP33778 126 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 SRP14P37108 136 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 HIST1H2BDP58876 126 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 HIST1H2BCP62807 126 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 SCGB2A2Q13296 93 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 HIST2H2BEQ16778 126 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 Q56UQ5 140 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 TMEM86BQ8N661 226 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 C5orf17Q8NAS9 161 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 BLNKQ8WV28 456 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 FRZBQ92765 325 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 KLK15Q9H2R5 256 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 SRD5A3Q9H8P0 318 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 OTORQ9NRC9 128 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 YAE1D1Q9NRH1 226 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 THYN1Q9P016 225 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 HIVEP2P31629 2446 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 UBE2CO00762 179 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 TGOLN2O43493 480 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 BUB3O43684 328 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 S100A9P06702 114 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 RPS10P46783 165 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 GNG4P50150 75 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 IL17RELQ6ZVW7 336 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 MS4A10Q96PG2 267 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 ATG101Q9BSB4 218 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 PRSS22Q9GZN4 317 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 OSTCQ9NRP0 149 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 FAM223BA6NKX1 122 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 C1orf196B1AJZ1 125 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 H3BUA1 57 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 AP4M1O00189 453 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 APOHP02749 345 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 C10orf99Q6UWK7 81 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 CLEC19AQ6UXS0 136 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 ZNF575Q86XF7 245 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 FAM223AQ8IWN6 122 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 NHLRC2Q8NBF2 726 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 MYOZ3Q8TDC0 251 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 IL36BQ9NZH7 164 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 HIVEP1P15822 2718 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 A0A087X0K7 114 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 A0A1W2PPQ1 181 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 PPP5D1E7EU14 171 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 NPIPB6E9PJ23 425 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 M0R3E3 92 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 PPP1R2P9O14990 202 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 PSMB8P28062 276 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 RAB5BP61020 215 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 PDE6HQ13956 83 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 ACTL10Q5JWF8 245 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 LCNL1Q6ZST4 164 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 Q86TA4 180 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 GPHB5Q86YW7 130 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 LYPD1Q8N2G4 141 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 SMIM12Q96EX1 92 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 SGK494Q96LW2 274 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 MTORP42345 2549 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 NF1P21359 2839 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 DIRC3C9JPN6 131 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 ZNF253O75346 499 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 LY6G6DO95868 133 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 TRGC1P0CF51 173 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 CRIP1P50238 77 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 CNN1P51911 297 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 COTL1Q14019 142 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 C9orf152Q5JTZ5 239 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-203ENST00000546585 COX8CQ7Z4L0 72 aa5.3□□□□□ -1.56
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