RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 RITA1Q96K30 269 aa8.6□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.6□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 IGLV2-23P01705 113 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 LYZP61626 148 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 UTF1Q5T230 341 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 RASL11BQ9BPW5 248 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 TPPP3Q9BW30 176 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 PROCRQ9UNN8 238 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 SPRY3O43610 288 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 CEACAM4O75871 244 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 ODF1Q14990 250 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 PRR31Q5SQ13 230 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 CCL13Q99616 98 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 SLC25A15Q9Y619 301 aa8.59□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 ZNF785A8K8V0 405 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 PRSS1P07477 247 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 AMN1Q8IY45 258 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 DSCAML1Q8TD84 2053 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 E7EUB6 86 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 H3BRN7 92 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 FAM106CPP0CH98 169 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 PLNP26678 52 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 KLRD1Q13241 179 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 RRN3P1Q2M238 152 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 FAM106AQ4KMX7 169 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 DKK2Q9UBU2 259 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 GPR179Q6PRD1 2367 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 A0A1B0GWB2 263 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 A6NJY4 79 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 NPIPB5A8MRT5 1133 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 KLK10O43240 276 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 IGHV3-48P01763 117 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 WFDC2Q14508 124 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 C12orf74Q32Q52 190 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 ASCL5Q7RTU5 278 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 H3BTX0 84 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 SH2D1AO60880 128 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 NPYP01303 97 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 LEPP41159 167 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 TCTAP57738 103 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 TM4SF20Q53R12 229 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 HCP5Q6MZN7 132 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 RAB1BQ9H0U4 201 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 TMEM213A2RRL7 107 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 H3BMG7 143 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 APOMO95445 188 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 CRIP1P50238 77 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 DEFB108BQ8NET1 73 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 CNFNQ9BYD5 112 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 OR11H12B2RN74 326 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 K7ERJ3 54 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 M0R1B8 84 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 SCGB2A1O75556 95 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 IGHV1-46P01743 117 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 ETDBQ3ZM63 59 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 Q8N8P6 123 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 C9orf106Q8NAJ2 232 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 OR11H1Q8NG94 326 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 OR11H2Q8NH07 326 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 HIST1H4GQ99525 98 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 RNF5Q99942 180 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 VCANP13611 3396 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 PRSS47A8MTI9 375 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 GOSR1O95249 250 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 RBP4P02753 201 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 IGLC6P0CF74 106 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 FAM201AQ5SY85 155 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms