RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534198.1

RBM4B-208, Transcript of RNA binding motif protein 4B, human

TSL 3

Gene RBM4B, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4B-208	ENST00000534198	CORT	O00230	105 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	SOCS3	O14543	225 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	ADAP1	O75689	374 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	ATG12	O94817	140 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	IGKV3-20	P01619	116 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	SEC11B	P0C7V7	166 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	6.07	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	RAB32	Q13637	225 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	SMCO1	Q147U7	214 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198		Q8WTZ3	238 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	C17orf77	Q96MU5	243 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	TP53RK	Q96S44	253 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	SEC11C	Q9BY50	192 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	UCP1	P25874	307 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	OPRK1	P41145	380 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	CAV2	P51636	162 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	PIGP	P57054	158 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	SVBP	Q8N300	66 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198		A8MTW9	85 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198		F6UB75	175 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198		K7EPK0	472 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	PI3	P19957	117 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	OR10J1	P30954	320 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	RND2	P52198	227 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	PAX9	P55771	341 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	XG	P55808	180 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	PSG9	Q00887	426 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	AMTN	Q6UX39	209 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	SLC35G3	Q8N808	338 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	NPIPB3	Q92617	1050 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	TOMM40	O96008	361 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	HBE1	P02100	147 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	IL4	P05112	153 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	HOXB5	P09067	269 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	OR5AC1	P0C628	307 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	RD3L	P0DJH9	198 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	PSG1	P11464	419 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	SPCS3	P61009	180 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	DAD1	P61803	113 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	ID3	Q02535	119 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	SP6	Q3SY56	376 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	C2orf83	Q53S99	150 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	FAM78B	Q5VT40	261 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	OR52E5	Q8NH55	327 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	C20orf173	Q96LM9	149 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198		Q9H8V8	135 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198		A0A0J9YX75	114 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	EPM2A	B3EWF7	344 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	UMAD1	C9J7I0	102 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	PITX3	O75364	302 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	SCO1	O75880	301 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	SNAPIN	O95295	136 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	AZU1	P20160	251 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	S100G	P29377	79 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	BAX	Q07812	192 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	BTN1A1	Q13410	526 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	RRN3P1	Q2M238	152 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	NMS	Q5H8A3	153 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RBM4B-208	ENST00000534198	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		6.03	□□□□□ -1.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms