RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 Q9UF83 564 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 RPS18P62269 152 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 RNF182Q8N6D2 247 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM52Q8NDY8 209 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 OR52N5Q8NH56 324 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 RITA1Q96K30 269 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 RTL8AQ9BWD3 113 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 GREB1Q4ZG55 1949 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 A0A1B0GWA3 101 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 TCRAP04437 139 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 LINC00643Q86TS7 51 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 MARCH3Q86UD3 253 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 FAM90A1Q86YD7 464 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 SERP2Q8N6R1 65 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 IFI27L1Q96BM0 104 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 STARD5Q9NSY2 213 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 VCANP13611 3396 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 HIGD1CA8MV81 97 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 IFI6P09912 130 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF138P52744 262 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 ATG2BQ96BY7 2078 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 H3BS24 57 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 SLC25A16P16260 332 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 LOXP28300 417 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 ASPHD1Q5U4P2 390 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 DCAF4L2Q8NA75 395 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 UPK3BQ9BT76 320 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 RNF7Q9UBF6 113 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 CACNA1GO43497 2377 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 PEX7O00628 323 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 SCRG1O75711 98 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 CA6P23280 308 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 UBE2D1P51668 147 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 Q6ZRU5 148 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 WFDC3Q8IUB2 231 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 HES7Q9BYE0 225 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 PLXNB2O15031 1838 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF883P0CG24 379 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 CTLA4P16410 223 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 PCBD1P61457 104 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 TFF3Q07654 80 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 PLXDC1Q8IUK5 500 aa4.87□□□□□ -1.63
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PDE4D-216ENST00000507116 C1orf159Q96HA4 380 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 FOXC2Q99958 501 aa4.87□□□□□ -1.63
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PDE4D-216ENST00000507116 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.87□□□□□ -1.63
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PDE4D-216ENST00000507116 EML5Q05BV3 1969 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 TRAV41A0A0B4J266 112 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 EFNA2O43921 213 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 IGLV2-8P01709 118 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 CTXN1P60606 82 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 SFTA2Q6UW10 78 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 C5orf38Q86SI9 138 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 MDP1Q86V88 176 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 SPTBP11277 2137 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 INS-IGF2F8WCM5 200 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 HBDP02042 147 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 DEFA4P12838 97 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 PLA2G5P39877 138 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 LOXL3P58215 753 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 PRR15Q8IV56 129 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 TDHQ8IZJ6 230 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 FAM168AQ92567 244 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 C17orf77Q96MU5 243 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 U3KQE9 123 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 COL6A3P12111 3177 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 SPTBN2O15020 2390 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 CCL16O15467 120 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 IGF1P05019 195 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 EMDP50402 254 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 LINC01559Q495D7 138 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 LINC00114Q6XXX2 140 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 SPACA5Q96QH8 159 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 EMC6Q9BV81 110 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 KLK14Q9P0G3 267 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 KNCNA6PVL3 124 aa4.86□□□□□ -1.63
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