RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498417.5

ANKRD54-210, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD54, Length 2,403 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-210ENST00000498417 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 NDUFS7O75251 213 aa12.2□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 IGHV3-23P01764 117 aa12.2□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa12.2□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 CLEC5AQ9NY25 188 aa12.2□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 NDUFB8O95169 186 aa12.2□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 BTF3P20290 206 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 Q56UQ5 140 aa12.2□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 CHEK1O14757 476 aa12.19□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 DTX2Q86UW9 622 aa12.19□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 NDFIP1Q9BT67 221 aa12.19□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 MED13LQ71F56 2210 aa12.19□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 ARMS2P0C7Q2 107 aa12.19□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 EBI3Q14213 229 aa12.19□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa12.19□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 C8orf49Q96NF6 230 aa12.19□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 C21orf62Q9NYP8 219 aa12.19□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 UQCR10Q9UDW1 63 aa12.19□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 K7EQM0 130 aa12.18□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 G0S2P27469 103 aa12.18□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 BATFQ16520 125 aa12.18□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 LINC00173Q6ZV60 143 aa12.18□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 COL6A6A6NMZ7 2263 aa12.18□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 TMEM190Q8WZ59 177 aa12.18□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa12.17□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 A0A1B0GUT8 65 aa12.17□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 ZNF138P52744 262 aa12.17□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 C1RLQ9NZP8 487 aa12.17□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 WNK2Q9Y3S1 2297 aa12.17□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa12.17□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 OR2T8A6NH00 312 aa12.17□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 LINC00614P0C842 121 aa12.17□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 PDE6HQ13956 83 aa12.17□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 FAM162BQ5T6X4 162 aa12.17□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 MINOS1Q5TGZ0 78 aa12.17□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 SIRPDQ9H106 197 aa12.17□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa12.17□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 OOSP1A8MZH6 123 aa12.16□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 CTSGP08311 255 aa12.16□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 TMEM11P17152 192 aa12.16□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 Q6ZN92 141 aa12.16□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa12.16□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 TXN2Q99757 166 aa12.16□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 TMEM70Q9BUB7 260 aa12.16□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 KLHDC1Q8N7A1 406 aa12.15□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 Q8N9W7 124 aa12.15□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 AJUBAQ96IF1 538 aa12.15□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 AAMDCQ9H7C9 122 aa12.15□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 LPAR2Q9HBW0 351 aa12.15□□□□□ -0.46
ANKRD54-210ENST00000498417 IGLL1P15814 213 aa12.15□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 THYN1Q9P016 225 aa12.15□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa12.15□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 CRXO43186 299 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 RIGQ13278 110 aa12.14□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 S100A7AQ86SG5 101 aa12.14□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 TFPI2P48307 235 aa12.13□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 GATD1Q8NB37 220 aa12.13□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 TMUB1Q9BVT8 246 aa12.13□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa12.13□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 LEPROTL1O95214 131 aa12.13□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 TMEM208Q9BTX3 173 aa12.13□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 TPPP3Q9BW30 176 aa12.13□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa12.12□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa12.12□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 IGHG4P01861 327 aa12.12□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 CSN3P07498 182 aa12.12□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 PSG9Q00887 426 aa12.12□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 IGFL4Q6B9Z1 124 aa12.12□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 SVEP1Q4LDE5 3571 aa12.12□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 CT45A10P0DMU9 189 aa12.12□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 RPL7P18124 248 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 TSPOP30536 169 aa12.12□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 CSN1S1P47710 185 aa12.12□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 STPG4Q8N801 248 aa12.12□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa12.12□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa12.11□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 SH2D1AO60880 128 aa12.11□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa12.11□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 OR4C46A6NHA9 309 aa12.11□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 FAM106CPP0CH98 169 aa12.11□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 HLA-DMBP28068 263 aa12.11□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa12.11□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 LYZL1Q6UWQ5 148 aa12.11□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 UBTD1Q9HAC8 227 aa12.11□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 RABAC1Q9UI14 185 aa12.11□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa12.11□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 C20orf202A1L168 122 aa12.1□□□□□ -0.47
ANKRD54-210ENST00000498417 UBE2E1P51965 193 aa12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms