RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	COL4A3	Q01955	1670 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PKD1-222	ENST00000496574	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
PKD1-222	ENST00000496574		H7C1H1	209 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PKD1-222	ENST00000496574	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PKD1-222	ENST00000496574	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM213	A2RRL7	107 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PKD1-222	ENST00000496574	TIMM23	O14925	209 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PKD1-222	ENST00000496574	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PKD1-222	ENST00000496574	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PKD1-222	ENST00000496574	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PKD1-222	ENST00000496574	COL4A6	Q14031	1691 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PKD1-222	ENST00000496574	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		11.46	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	TMPRSS3	P57727	454 aa		11.46	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		11.46	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	CCL21	O00585	134 aa		11.46	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	IGKV3-20	P01619	116 aa		11.46	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	HAX1	O00165	279 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574		A0A1W2PPI3	338 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	TRGV3	P03979	118 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	WNT2	P09544	360 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574		F8W1H4	67 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	YPEL4	Q96NS1	127 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF883	P0CG24	379 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	CSTL1	Q9H114	145 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	ABCA4	P78363	2273 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	LINC01549	A6NIU2	74 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	GAFA1	Q96PS6	74 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	AZU1	P20160	251 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	DDB2	Q92466	427 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	PSMB11	A5LHX3	300 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	TNFRSF6B	O95407	300 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	PAX1	P15863	534 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	ATP6V0B	Q99437	205 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF747	Q9BV97	191 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	C15orf65	H3BRN8	121 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	CACNA1B	Q00975	2339 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	RHOG	P84095	191 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	VGLL1	Q99990	258 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	SAP30	O75446	220 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	PDE6H	Q13956	83 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	FXYD5	Q96DB9	178 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	PRSS46	E5RG02	174 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	SIVA1	O15304	175 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF134	P52741	427 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	RNF182	Q8N6D2	247 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574		Q6ZR03	302 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	GLMP	Q8WWB7	406 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574		H3BMG7	143 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	NPFF	O15130	113 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	WT1-AS	Q06250	92 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PKD1-222	ENST00000496574	CD7	P09564	240 aa		11.4	□□□□□ -0.59
PKD1-222	ENST00000496574	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		11.4	□□□□□ -0.59
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		11.4	□□□□□ -0.59
PKD1-222	ENST00000496574	RNF5	Q99942	180 aa		11.4	□□□□□ -0.59
PKD1-222	ENST00000496574	THADA	Q6YHU6	1953 aa		11.4	□□□□□ -0.59
PKD1-222	ENST00000496574	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PKD1-222	ENST00000496574	TAX1BP3	O14907	124 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PKD1-222	ENST00000496574	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PKD1-222	ENST00000496574	MDS2	Q8NDY4	140 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PKD1-222	ENST00000496574	LINC01560	Q8TB33	94 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PKD1-222	ENST00000496574	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
PKD1-222	ENST00000496574	POU2AF1	Q16633	256 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PKD1-222	ENST00000496574	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PKD1-222	ENST00000496574	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PKD1-222	ENST00000496574	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PKD1-222	ENST00000496574	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PKD1-222	ENST00000496574	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM178B	H3BS89	294 aa		11.38	□□□□□ -0.59

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