RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 LINC00173Q6ZV60 143 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 ZNF738Q8NE65 137 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 PMCHL2Q9BQD1 86 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 SNAI2O43623 268 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 DTX2Q86UW9 622 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 NPBQ8NG41 125 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 C18orf32Q8TCD1 76 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 hDV102S1A0JD36 115 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 OR2T8A6NH00 312 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 HIGD1CA8MV81 97 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 NDUFA3O95167 84 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-23P01764 117 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 CEACAM3P40198 252 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 KLF12Q9Y4X4 402 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 TCRAP04437 139 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 FOXE3Q13461 319 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 ORAOV1Q8WV07 137 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 GRAMD2BQ96HH9 432 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 C19orf84I3L1E1 186 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 CFAP161Q6P656 301 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 FAM231DQ6ZW35 169 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 TCF24Q7RTU0 167 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 C5orf17Q8NAS9 161 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 GPR82Q96P67 336 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 FANCD2OSQ96PS1 177 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 CELSR2Q9HCU4 2923 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 M0R2Z0 102 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 HSBP1O75506 76 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 ZNF491Q8N8L2 437 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 OR4F17Q8NGA8 305 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 OR2D3Q8NGH3 330 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 MLST8Q9BVC4 326 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 IL4P05112 153 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 FAM120AOSQ5T036 256 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 TOMM40O96008 361 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 CDKN1BP46527 198 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 IGSF10Q6WRI0 2623 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 ARPC1AQ92747 370 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 MUC21A0A140T8X8 626 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 FAM181BA6NEQ2 426 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 NUDT3O95989 172 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 LTAP01374 205 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 GNLYP22749 145 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 ZNF138P52744 262 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 MUC21Q5SSG8 566 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 PRNTQ86SH4 94 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 ABCA2Q9BZC7 2435 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 A6NJY4 79 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 F8W735 103 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 TMEM95Q3KNT9 176 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 ZNF562Q6V9R5 426 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 RNF125Q96EQ8 232 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 SIRPDQ9H106 197 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 OTORQ9NRC9 128 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 TMEM14CQ9P0S9 112 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 H3BRN7 92 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 GNG7O60262 68 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 OR2J3O76001 311 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 IGLV2-11P01706 119 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 RIPPLY3P57055 190 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 RASL11AQ6T310 242 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 Q8N6K4 173 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 GTSF1Q8WW33 167 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 FMC1Q96HJ9 113 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 CACNA1AO00555 2505 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 MYO18BQ8IUG5 2567 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-213ENST00000492657 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PRAME-213ENST00000492657 TMEM11P17152 192 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-213ENST00000492657 KLHDC1Q8N7A1 406 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-213ENST00000492657 CHRDL1Q9BU40 450 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-213ENST00000492657 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
PRAME-213ENST00000492657 CENPEQ02224 2701 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-213ENST00000492657 ACACBO00763 2458 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-213ENST00000492657 TRBV19A0A075B6N1 114 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-213ENST00000492657 C19orf71A6NCJ1 209 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-213ENST00000492657 ZNF785A8K8V0 405 aa10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.3 ms