RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 NIT2Q9NQR4 276 aa0.19□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 PLAC8Q9NZF1 115 aa0.19□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 TNCP24821 2201 aa0.19□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 INSL3P51460 131 aa0.18□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 REEP5Q00765 189 aa0.18□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 SPATA45Q537H7 98 aa0.18□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 ATOH7Q8N100 152 aa0.18□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 MNS1Q8NEH6 495 aa0.18□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 OR10AC1Q8NH08 325 aa0.18□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 PPTC7Q8NI37 304 aa0.18□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 MED29Q9NX70 200 aa0.18□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 ASB4Q9Y574 426 aa0.18□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 ARL5AQ9Y689 179 aa0.18□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 BCL9O00512 1426 aa0.18□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 ERBINQ96RT1 1412 aa0.18□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 MYH2Q9UKX2 1941 aa0.18□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa0.17□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 BANF1O75531 89 aa0.17□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 HSD11B1P28845 292 aa0.17□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 CAPZBP47756 277 aa0.17□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa0.17□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 NISCHQ9Y2I1 1504 aa0.17□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa0.16□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 KNTC1P50748 2209 aa0.16□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 MAST4O15021 2626 aa0.16□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM210A6NLX4 147 aa0.16□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 CD14P08571 375 aa0.16□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 CXCL1P09341 107 aa0.16□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 ARPP19P56211 112 aa0.16□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa0.16□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 PRNDQ9UKY0 176 aa0.16□□□□□ -2.38
ITGA4-211ENST00000490435 NDUFC2O95298 119 aa0.15□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 S100A6P06703 90 aa0.15□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 OR4K15Q8NH41 348 aa0.15□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 HSPB8Q9UJY1 196 aa0.15□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 PYCARDQ9ULZ3 195 aa0.15□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 FSIP2Q5CZC0 6907 aa0.15□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 NCAPD3P42695 1498 aa0.15□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa0.14□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 hDV103S1A0JD37 113 aa0.14□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 C9orf170A2RU37 121 aa0.14□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 K7ERJ3 54 aa0.14□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 E2F6O75461 281 aa0.14□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 TRGC2P03986 189 aa0.14□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 TMBIM6P55061 237 aa0.14□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 SPINK7P58062 85 aa0.14□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 VBP1P61758 197 aa0.14□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 GNG5P63218 68 aa0.14□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 KLRD1Q13241 179 aa0.14□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa0.14□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 PHB2Q99623 299 aa0.14□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 OR2J1Q9GZK6 312 aa0.14□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa0.13□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 NUPR2A6NF83 97 aa0.13□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 C5orf67F2Z3F1 127 aa0.13□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 G3V2T6 193 aa0.13□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF137PP52743 207 aa0.13□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 LRRC18Q8N456 261 aa0.13□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF714Q96N38 554 aa0.13□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa0.13□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 TRAV5A0A0B4J249 113 aa0.12□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 ODAMA1E959 279 aa0.12□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 AIPO00170 330 aa0.12□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 IGHV3-33P01772 117 aa0.12□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 SPINT3P49223 89 aa0.12□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 FXYD4P59646 89 aa0.12□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa0.12□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 C6orf52Q5T4I8 152 aa0.12□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 Q6ZS92 163 aa0.12□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 PXT1Q8NFP0 134 aa0.12□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 MYH3P11055 1940 aa0.12□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 CD109Q6YHK3 1445 aa0.12□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 PIK3C2AO00443 1686 aa0.11□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF727A8MUV8 499 aa0.11□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 H7C1C5 153 aa0.11□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 RER1O15258 196 aa0.11□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 IDO1P14902 403 aa0.11□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 LCN6P62502 163 aa0.11□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 TMED2Q15363 201 aa0.11□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 MSMO1Q15800 293 aa0.11□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 OCIAD2Q56VL3 154 aa0.11□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 FOXI2Q6ZQN5 318 aa0.11□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 SH3BGRL3Q9H299 93 aa0.11□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 LOC285556D6RIA3 1793 aa0.1□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 RIIAD1A6NNX1 92 aa0.1□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 HIST1H2BKO60814 126 aa0.1□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 ATG12O94817 140 aa0.1□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 IFNA14P01570 189 aa0.1□□□□□ -2.39
ITGA4-211ENST00000490435 IFNA4P05014 189 aa0.1□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms