RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 LCN8Q6JVE9 175 aa2.29□□□□□ -2.04
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SHQ1-208ENST00000482785 DPPA2Q7Z7J5 298 aa2.29□□□□□ -2.04
SHQ1-208ENST00000482785 HMGN2P46Q86SG4 172 aa2.29□□□□□ -2.04
SHQ1-208ENST00000482785 C20orf196Q8IYI0 205 aa2.29□□□□□ -2.04
SHQ1-208ENST00000482785 C10orf111Q8N326 155 aa2.29□□□□□ -2.04
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SHQ1-208ENST00000482785 RNF5Q99942 180 aa2.27□□□□□ -2.05
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SHQ1-208ENST00000482785 GNB1LQ9BYB4 327 aa2.27□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 FAM107BQ9H098 131 aa2.27□□□□□ -2.05
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SHQ1-208ENST00000482785 GID8Q9NWU2 228 aa2.27□□□□□ -2.05
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