RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 SAMD13Q5VXD3 122 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 SLC17A3O00476 420 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 ISLRO14498 428 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 ZNF688P0C7X2 276 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 STAG3L2P0CL84 134 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 STAG3L3P0CL85 134 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 PSMB3P49720 205 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 FHITP49789 147 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 GUK1Q16774 197 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 PAXXQ9BUH6 204 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 OR51M1Q9H341 326 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 UBQLN2Q9UHD9 624 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 TRBV19A0A075B6N1 114 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 H3BTX0 84 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 OR7C2O60412 319 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 NDUFB4O95168 129 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 LCN15Q6UWW0 184 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 RNF141Q8WVD5 230 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 OR11H12B2RN74 326 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 ZNF253O75346 499 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 OR10J4P0C629 311 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 ARL14EPLP0DKL9 152 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 PQLC2Q6ZP29 291 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 C20orf173Q96LM9 149 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 CITED4Q96RK1 184 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 DEFB131AP59861 70 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 DEFA6Q01524 100 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 PDE6HQ13956 83 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 ZNF124Q15973 351 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 PSMG4Q5JS54 123 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 IGFL4Q6B9Z1 124 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 DEFB125Q8N687 156 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 PHYHIPLQ96FC7 376 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 C16orf92Q96LL3 132 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 NBEAP1P0C6P0 100 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 APRG1Q8IVJ8 170 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 RNF182Q8N6D2 247 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 SUN5Q8TC36 379 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 SLC50A1Q9BRV3 221 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 A8MZ25 164 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 HLA-DMBP28068 263 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 GCHFRP30047 84 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 ID1P41134 155 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 SULT1A2P50226 295 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 FAM213BQ8TBF2 198 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 CXorf1O96002 111 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 RAB5CP51148 216 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 FAM74A1Q5RGS3 127 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 BLNKQ8WV28 456 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 MBD3L1Q8WWY6 194 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 DEFB1P60022 68 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 ALKAL2Q6UX46 152 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 LINC00052Q96N35 136 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 PSG3Q16557 428 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 LRRC20Q8TCA0 184 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 SRD5A3Q9H8P0 318 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 KNCNA6PVL3 124 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 CLEC5AQ9NY25 188 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 PSG9Q00887 426 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 GDF5OSQ5U4N7 250 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 FOXI2Q6ZQN5 318 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 MRAPQ8TCY5 172 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 TMEM167BQ9NRX6 74 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 F6UB75 175 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 M0R3E3 92 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 RANP62826 216 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 LYPD1Q8N2G4 141 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 ZNF738Q8NE65 137 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 SFT2D1Q8WV19 159 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 Q9H3A6 140 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-210ENST00000477812 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-210ENST00000477812 PRAC2D3DTV9 90 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-210ENST00000477812 H2AFB1P0C5Y9 115 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-210ENST00000477812 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-210ENST00000477812 HLA-DRB4P13762 266 aa14.7□□□□□ -0.06
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