RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 C3orf56Q8N813 242 aa18.34■□□□□ 0.53
NME4-209ENST00000460297 VAX2Q9UIW0 290 aa18.34■□□□□ 0.53
NME4-209ENST00000460297 ZNF785A8K8V0 405 aa18.33■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 CD5P06127 495 aa18.33■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 BMI1P35226 326 aa18.33■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 ATP5G3P48201 142 aa18.33■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 RANP62826 216 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 CST9LP1Q5W188 147 aa18.33■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa18.33■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 RXFP4Q8TDU9 374 aa18.33■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa18.33■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 A0A1W2PRE2 83 aa18.32■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 C9JQL5 133 aa18.32■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 FAM90A2PQ658T7 463 aa18.32■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 TCF24Q7RTU0 167 aa18.32■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 LINC00482Q8N8I6 264 aa18.32■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 GGTLC3B5MD39 225 aa18.31■□□□□ 0.52
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NME4-209ENST00000460297 HELTA6NFD8 242 aa18.31■□□□□ 0.52
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NME4-209ENST00000460297 M0QZ24 198 aa18.31■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
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NME4-209ENST00000460297 PDE6HQ13956 83 aa18.31■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 CITED4Q96RK1 184 aa18.31■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 RPL11P62913 178 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 PEA15Q15121 130 aa18.29■□□□□ 0.52
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NME4-209ENST00000460297 Q9H3A6 140 aa18.29■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa18.28■□□□□ 0.52
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NME4-209ENST00000460297 SHISA2Q6UWI4 295 aa18.28■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa18.28■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 TREM1Q9NP99 234 aa18.28■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa18.28■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 ZNF253O75346 499 aa18.28■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 SPATA3Q8NHX4 192 aa18.28■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 NRN1Q9NPD7 142 aa18.28■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 PGPA6NDG6 321 aa18.27■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 DEFB114Q30KQ6 69 aa18.27■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 IGFL4Q6B9Z1 124 aa18.27■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 TXNDC17Q9BRA2 123 aa18.27■□□□□ 0.52
NME4-209ENST00000460297 SRP19P09132 144 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
NME4-209ENST00000460297 MEOX2P50222 304 aa18.26■□□□□ 0.51
NME4-209ENST00000460297 LYPD1Q8N2G4 141 aa18.26■□□□□ 0.51
NME4-209ENST00000460297 DYNLRB2Q8TF09 96 aa18.26■□□□□ 0.51
NME4-209ENST00000460297 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
NME4-209ENST00000460297 SMDT1Q9H4I9 107 aa18.26■□□□□ 0.51
NME4-209ENST00000460297 OTORQ9NRC9 128 aa18.26■□□□□ 0.51
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NME4-209ENST00000460297 GBGT1Q8N5D6 347 aa18.25■□□□□ 0.51
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NME4-209ENST00000460297 SOCS3O14543 225 aa18.25■□□□□ 0.51
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NME4-209ENST00000460297 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
NME4-209ENST00000460297 RNF182Q8N6D2 247 aa18.23■□□□□ 0.51
NME4-209ENST00000460297 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa18.23■□□□□ 0.51
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NME4-209ENST00000460297 SCO2A0A1W2PP80 73 aa18.22■□□□□ 0.51
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NME4-209ENST00000460297 PDE6DO43924 150 aa18.22■□□□□ 0.51
NME4-209ENST00000460297 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
NME4-209ENST00000460297 C16orf92Q96LL3 132 aa18.22■□□□□ 0.51
NME4-209ENST00000460297 SLC35B3Q9H1N7 401 aa18.22■□□□□ 0.51
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NME4-209ENST00000460297 C5orf17Q8NAS9 161 aa18.22■□□□□ 0.51
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NME4-209ENST00000460297 F6UZH7 168 aa18.2■□□□□ 0.5
NME4-209ENST00000460297 TMEM250H0YL14 139 aa18.2■□□□□ 0.5
NME4-209ENST00000460297 TSPAN4O14817 238 aa18.2■□□□□ 0.5
NME4-209ENST00000460297 CEBPGP53567 150 aa18.2■□□□□ 0.5
NME4-209ENST00000460297 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
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NME4-209ENST00000460297 C11orf52Q96A22 123 aa18.19■□□□□ 0.5
NME4-209ENST00000460297 C20orf173Q96LM9 149 aa18.19■□□□□ 0.5
NME4-209ENST00000460297 K7EQG2 157 aa18.18■□□□□ 0.5
NME4-209ENST00000460297 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
NME4-209ENST00000460297 ISLRO14498 428 aa18.18■□□□□ 0.5
NME4-209ENST00000460297 FAM24BQ8N5W8 94 aa18.18■□□□□ 0.5
NME4-209ENST00000460297 RPH3ALQ9UNE2 315 aa18.18■□□□□ 0.5
NME4-209ENST00000460297 SORL1Q92673 2214 aa18.18■□□□□ 0.5
NME4-209ENST00000460297 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
NME4-209ENST00000460297 CMTM2Q8TAZ6 248 aa18.18■□□□□ 0.5
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