RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453727.6

LMO3-210, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5

Gene LMO3, Length 2,403 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-210ENST00000453727 TIGITQ495A1 244 aa6.82□□□□□ -1.32
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LMO3-210ENST00000453727 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.79□□□□□ -1.32
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LMO3-210ENST00000453727 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 A0A1W2PRE2 83 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 SLC25A16P16260 332 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 GCHFRP30047 84 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 CAMPP49913 170 aa6.78□□□□□ -1.32
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