RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SELENBP1-208	ENST00000447402	PAXX	Q9BUH6	204 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SELENBP1-208	ENST00000447402	HRH4	Q9H3N8	390 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SELENBP1-208	ENST00000447402		H3BQ15	152 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNF141	Q8WVD5	230 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	TUBA4B	Q9H853	241 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402		A0A087X0K7	114 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	UMAD1	C9J7I0	102 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402		K7EIL1	84 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGLC2	P0DOY2	106 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	LCN15	Q6UWW0	184 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	MRAP	Q8TCY5	172 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	ISLR	O14498	428 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	SOCS3	O14543	225 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	PSMB3	P49720	205 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	FHIT	P49789	147 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF124	Q15973	351 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	GUK1	Q16774	197 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNF182	Q8N6D2	247 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC17A3	O00476	420 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF726P1	Q15940	193 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	SSX7	Q7RTT5	188 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF503	Q96F45	646 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	CXorf1	O96002	111 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	STAG3L2	P0CL84	134 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	STAG3L3	P0CL85	134 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	FXYD5	Q96DB9	178 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	HLA-DMB	P28068	263 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	C20orf173	Q96LM9	149 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	CITED4	Q96RK1	184 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402		A0A1B0GV50	99 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	KNCN	A6PVL3	124 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	GCHFR	P30047	84 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	DEFB1	P60022	68 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	PSG9	Q00887	426 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	PDE6H	Q13956	83 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	STH	Q8IWL8	128 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF738	Q8NE65	137 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	NDUFB4	O95168	129 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	SULT1A2	P50226	295 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	RAB5C	P51148	216 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	PSG3	Q16557	428 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SELENBP1-208	ENST00000447402		F6UB75	175 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF253	O75346	499 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SELENBP1-208	ENST00000447402	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SELENBP1-208	ENST00000447402	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SELENBP1-208	ENST00000447402	ICAM4	Q14773	271 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SELENBP1-208	ENST00000447402	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGKV3-20	P01619	116 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SELENBP1-208	ENST00000447402	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SELENBP1-208	ENST00000447402	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SELENBP1-208	ENST00000447402		Q9H3A6	140 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SELENBP1-208	ENST00000447402	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SELENBP1-208	ENST00000447402	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SELENBP1-208	ENST00000447402	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SELENBP1-208	ENST00000447402		M0R3E3	92 aa		10.12	□□□□□ -0.79

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