RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00312Q9Y6C7 94 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 C15orf61A6NNL5 157 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLL5B9A064 214 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 SSR4P51571 173 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 C16orf97H3BN30 126 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 J3QLI3 93 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 XGP55808 180 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 Q8IYB0 196 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 RPRMLQ8N4K4 120 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 ITLN1Q8WWA0 313 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 S1PR3Q99500 378 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 DKK2Q9UBU2 259 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 PIEZO1Q92508 2521 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 GNG12Q9UBI6 72 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 PGPA6NDG6 321 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 COX7A2P2O60397 106 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 GAGE5Q13069 117 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 GAGE6Q13070 117 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 FHL3Q13643 280 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 EDDM3AQ14507 147 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZUT4 128 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM178AQ8NBL3 297 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 RAX2Q96IS3 184 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 PRO0461Q9UI25 63 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 EPDR1Q9UM22 224 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 V9GYY9 64 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 H3BTX0 84 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 COL8A1P27658 744 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 PLGLB1Q02325 96 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXI1Q12951 378 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 PLP2Q04941 152 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 Q0VFX4 171 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 KLRD1Q13241 179 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 FXYD5Q96DB9 178 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 MLST8Q9BVC4 326 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 FZR1Q9UM11 496 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 HAX1O00165 279 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 PRRG2O14669 202 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV3-48P01763 117 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 KLRB1Q12918 225 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 PDPNQ86YL7 162 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 CEND1Q8N111 149 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 TM2D2Q9BX73 214 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 SPINT2O43291 252 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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RABGEF1-203ENST00000439720 RETNQ9HD89 108 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GUT8 65 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 SRYQ05066 204 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 PRELID3AQ96N28 172 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.69□□□□□ -1.34
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RABGEF1-203ENST00000439720 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 C12orf74Q32Q52 190 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 PATE2Q6UY27 113 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 NFE4Q86UQ8 179 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 MDS2Q8NDY4 140 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 IL17DQ8TAD2 202 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 LEAP2Q969E1 77 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 hADV38S2A0JD32 116 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 D6R8Y8 96 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 HBDP02042 147 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 CD3EP07766 207 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 FCER1GP30273 86 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF134P52741 427 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 MRAPQ8TCY5 172 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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