RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436668.5

TTLL4-208, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 4, human

TSL 5

Gene TTLL4, Length 738 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL4-208	ENST00000436668	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		5	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		5	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	PEMT	Q9UBM1	199 aa		5	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		5	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		5	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	TMEM213	A2RRL7	107 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	HELT	A6NFD8	242 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	NDUFB4	O95168	129 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	FOLR2	P14207	255 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	CBLN1	P23435	193 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	PSG9	Q00887	426 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668		Q9H3A6	140 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	OTOR	Q9NRC9	128 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	ATR	Q13535	2644 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668		A0A087X0K7	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	ZNF727	A8MUV8	499 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668		A8MWP6	167 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	SLC17A3	O00476	420 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	APOC3	P02656	99 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	EDN2	P20800	178 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	MYCNOS	P40205	109 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	CSN1S1	P47710	185 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	MEOX2	P50222	304 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	PDE6H	Q13956	83 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	SEC11C	Q9BY50	192 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	EPDR1	Q9UM22	224 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	PEX7	O00628	323 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	OVOL1	O14753	267 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	ZNF253	O75346	499 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	CSN3	P07498	182 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	AKR1C3	P42330	323 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	GNG5	P63218	68 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	FHL3	Q13643	280 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	PARL	Q9H300	379 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TTLL4-208	ENST00000436668		K7EQM0	130 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTLL4-208	ENST00000436668		M0R036	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTLL4-208	ENST00000436668	PF4	P02776	101 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTLL4-208	ENST00000436668	TCRA	P04437	139 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTLL4-208	ENST00000436668	HLA-DMB	P28068	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTLL4-208	ENST00000436668	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TTLL4-208	ENST00000436668	TFPI2	P48307	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTLL4-208	ENST00000436668	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TTLL4-208	ENST00000436668	PAFAH1B2	P68402	229 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTLL4-208	ENST00000436668	GUCA2B	Q16661	112 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTLL4-208	ENST00000436668	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTLL4-208	ENST00000436668	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTLL4-208	ENST00000436668	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTLL4-208	ENST00000436668	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TTLL4-208	ENST00000436668	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTLL4-208	ENST00000436668	SVBP	Q8N300	66 aa		4.96	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms