RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
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SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PPR1 153 aa14.77□□□□□ -0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 PPIAL4GP0DN37 164 aa14.77□□□□□ -0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM14CQ9P0S9 112 aa14.77□□□□□ -0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 C20orf202A1L168 122 aa14.77□□□□□ -0.05
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SH3BP1-202ENST00000417536 hDV102S1A0JD36 115 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM231BA6NCW3 169 aa14.75□□□□□ -0.05
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SH3BP1-202ENST00000417536 APOHP02749 345 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
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SH3BP1-202ENST00000417536 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SH3BP1-202ENST00000417536 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa14.73□□□□□ -0.05
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SH3BP1-202ENST00000417536 M0R3E3 92 aa14.71□□□□□ -0.05
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SH3BP1-202ENST00000417536 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM75Q8N9X5 138 aa14.71□□□□□ -0.06
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SH3BP1-202ENST00000417536 COX11Q9Y6N1 276 aa14.71□□□□□ -0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM191AQ9H0A3 160 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 ST20Q9HBF5 79 aa14.7□□□□□ -0.06
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SH3BP1-202ENST00000417536 PSG3Q16557 428 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 ARF6P62330 175 aa14.69□□□□□ -0.06
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SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PRM7 423 aa14.68□□□□□ -0.06
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SH3BP1-202ENST00000417536 C8orf49Q96NF6 230 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF5Q99942 180 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa14.68□□□□□ -0.06
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF414Q96IQ9 312 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 CHD6Q8TD26 2715 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 NBR2O15453 112 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF24Q9Y225 148 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 HES1Q14469 280 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 FBLN7Q53RD9 439 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 GNG7O60262 68 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 KLRD1Q13241 179 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC25A34Q6PIV7 304 aa14.67□□□□□ -0.06
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